Сравнительный анализ интегрированных последовательностей ДНК у штаммов стрептококков группы B

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В настоящей статье представлены данные о рестрикционном полиморфизме интегрированных последовательностей ДНК (IS элементов) стрептококков группы B. У 29 из 113 штаммов не было обнаружено ни одного из четырех известных IS элементов (IS1548, IS861, ISSa4, IS1381). У остальных штаммов количество различных IS элементов варьировало от 1 до 3, и не было обнаружено ни одного штамма, у которого бы присутствовали все 4 IS элемента. Среди проанализированных штаммов были обнаружены 6, 9, 13 и 38 различных рестрикционных паттернов ДНК, гибридизующихся с зондами на IS1548, IS861, ISSa4 и IS1381 соответственно. Показано, что данные о наличии IS элементов могут явиться эффективным дополнительным средством к серодиагностике в интересах изучения эпидемиологии стрептококков группы B.

Об авторах

А. В. Дмитриев

Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН

Автор, ответственный за переписку.
Email: shabanov@mail.rcom.ru
Россия, 197376, Санкт Петербург

А. D. Shen

Пекинский детский госпиталь

Email: shabanov@mail.rcom.ru
Китай, 100045, Пекин

Y. Н. Yang

Пекинский детский госпиталь

Email: shabanov@mail.rcom.ru
Китай, 100045, Пекин

А. А. Тотолян

Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН

Email: shabanov@mail.rcom.ru

академик РАМН

Россия, 197376, Санкт Петербург

Список литературы

  1. Дмитриев А. В., Шаклеина Е. В. Молекулярная эпидемиология патогенных стрептококков группы В // ЖМЭИ. 2003. № 1 (в печати).
  2. Colman G. Typing of Streptococcus agalactiae (Lancefield group B) // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1988. Vol. 7. P. 226-231.
  3. Chatellier S., Huet H., Kenzi S. et al. Genetic diversity of rRNA operons of unrelated Streptococcus agalactiae strains isolated from cerebrospinal fluid of neonates suffering from meningitis // J. Clin. Microbiol. 1996. Vol. 34. P. 2741-2747.
  4. Dmitriev A., Hu Y. Y, Shen A. D. et al. Chromosomal analysis of group В streptococcal clinical strains; bac gene positive strains are genetically homogenous // FEMS Microbiol. Lett. 2002. Vol. 208. P. 93-98.
  5. Dmitriev A., Shakleina E., Tkacikova L. et al. Genetic heterogeneity of the pathogenic potentials of human and bovine group В streptococci // Folia Microbiol. 2002. Vol. 47. P. 291-295.
  6. Ferretti J., McShan W., AJdic D. et al. Complete genome sequence of an Ml strain of Streptococcus pyogenes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. Vol. 98. P. 4658-1663.
  7. Granlund M., Oberg L., Sellin M. et al. Identification of a novel insertion element, IS 1548, in group В streptococci, predominantly in strains causing endocarditis // J. Infect. Dis. 1998. Vol. 177. P. 967-976.
  8. Gray В. M., Dillon H. C. GBS infections in mothers and their infants // Antiobiot. Chemother. 1985. Vol. 3 5. P. 225-23 6.
  9. Hauge M., Jespersgaard C., Poulsen K. et al. Population structure of Streptococcus agalactiae reveals an association between specific evolutionary lineages and putative virulence factors but not disease // Infect. Immun. 1996. Vol. 64. P. 919-925.
  10. Hoe N., Nakashima K., Grigsby D. et al. Rapid molecular genetic subtyping of serotype Ml group A Streptococcus strains // Emerg. Infect. Dis. 1999. Vol. 5. P. 254-263.
  11. Kong F., Gowan S., Martin D. et al. Molecular profiles of group B streptococcal surface protein antigen genes: relationship to molecular serotypes // J. Clin. Microbiol. 2002. Vol. 40. P. 620-626.
  12. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor. NY, 1982.
  13. Mahillon J., Chandler M. Insertion sequences // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. Vol. 62. P. 725-774.
  14. Quentin R., Huet H., Wang F-S. et al. Characterization of Streptococcus agalactiae strains by multilocus enzyme genotype and serotype: identification of multiple virulent clone families that cause invasive neonatal diseases // J. Clin. Microbiol. 1995. Vol. 33. P. 2576-2581.
  15. Rolland K., Marois C., Siquier V. et al. Genetic features of Streptococcus agalactiae strains causing severe neonatal infections, as revealed by pulsed-field gel electrophoresis and hylB gene analysis // J. Clin. Microbiol. 1999. Vol. 37. P. 1892-1898.
  16. Rubens С. E., Heggen L. M. and Kuypers J. M. IS861, a group B streptococcal insertion sequence related to IS 150 and IS3 of Escherichia colU/E Bacteriol. 1989. Vol. 171. P. 5531-5535.
  17. Sanchez-Beato A. R., Garcia E., Lopez R. et al. Identification and characterization of IS 1381, a new insertion sequence in Streptococcus pneumoniae // J. Bacteriol. 1997. Vol. 179. P. 2459-2463.
  18. Spellerberg B., Martin S., Franken C. et al. Identification of a novel insertion sequence element in Streptococcus agalactiae // Gene. 2000. Vol. 241. P. 51-56.
  19. Tamura G. S., Herndon M., Przekwas J. et al. Analysis of restriction fragment length polymorphisms of the insertion sequence IS 1381 in group B streptococci // J. Infect. Dis. 2000. Vol. 181. P. 364-368.
  20. Tettelin H., Masignani V., Cieslewicz M. J. et al. Complete genome sequence and comparative genomic analysis of an emerging human pathogen, serotype V Streptococcus agalactiae II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. P. 123 91-123 96.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Эко-Вектор, 2003


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.