Оценка прогностического значения биомаркера и определение его верхней границы нормы

Обложка


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

 

Цель — разработать алгоритм оценки прогностической ценности биомаркера (тропонин I) в отношении летальных исходов после операций коронарного шунтирования.

Задачи — оценить пригодность биомаркера тропонина I для прогнозирования летальных исходов после операций коронарного шунтирования, построить график вероятности летальных исходов в зависимости от концентрации биомаркера тропонина I, определить верхнюю границу нормы концентрации тропонина I после операций коронарного шунтирования.

Материалы и методы. В проспективное нерандомизированное исследование AMIRI – CABG в ПСПбГМУ им. И.П. Павлова с 2016 по 2019 г. включено 336 пациентов после операций коронарного шунтирования. Создана база данных с результатами клинических, лабораторных и инструментальных исследований. Статистическая обработка данных выполнена с помощью лицензионного программного обеспечения SAS Enterprise Guide 6.1. Пригодность биомаркера тропонина I для прогнозирования летальных исходов оценивали с применением логистической регрессии. Для построения графика вероятности летальных исходов в зависимости от концентрации тропонина I использовали коэффициенты логистической регрессии. Верхняя граница нормы биомаркера была определена путем расчета индекса Юдена.

Результаты. Разработан алгоритм обработки данных, позволяющий определить прогностическую ценность биомаркера для клинического применения, а также верхнюю границу нормы. Данный алгоритм может быть использован врачами различных специальностей, научными сотрудниками, биологами для обработки результатов научных и клинических исследований.

Заключение. Следуя алгоритму обработки данных научного исследования, врачи и научные сотрудники смогут определить прогностическую ценность и применимость в клинической практике новых биомаркеров.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Николай Сергеевич Буненков

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Первый Санкт‑Петербургский медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации

Автор, ответственный за переписку.
Email: bunenkov2006@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4331-028X

аспирант кафедры факультетской хирургии

Россия, Санкт-Петербург

Гульнара Фазулиевна Буненкова

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Первый Санкт‑Петербургский медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: gulnara533@gmail.com

клинический ординатор кафедры госпитальной терапии

Россия, Санкт-Петербург

Владимир Владимирович Комок

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Первый Санкт‑Петербургский медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: vladimir_komok@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-3834-7566
SPIN-код: 3572-5180

канд. мед. наук, кардиохирург отделения кардиохирургии № 2

Россия, Санкт-Петербург

Олег Александрович Гриненко

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Первый Санкт‑Петербургский медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: klinika@spb-gmu.ru

д. м. н., проректор по лечебной работе

Россия, Санкт-Петербург

Александр Сергеевич Немков

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Первый Санкт‑Петербургский медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: nemk_as@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5152-0001
SPIN-код: 2853-4634

д-р мед. наук, профессор, кардиохирург отделения кардиохирургии № 2

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Nattino G, Pennell ML, Lemeshow S. Assessing the goodness of fit of logistic regression models in large samples: A modification of the Hosmer-Lemeshow test. Biometrics. 2020. https://doi.org/10.1111/biom.13249.
  2. Thielmann M, Sharma V, Al-Attar N, et al. ESC Joint Working Groups on Cardiovascular Surgery and the Cellular Biology of the Heart Position Paper: Perioperative myocardial injury and infarction in patients undergoing coronary artery bypass graft surgery. Eur Heart J. 2017;38(31):2392-2407. https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehx383.
  3. Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Белый С.А., и др. SAS Enterprise Guide 6.1 для врачей: начало работы // Медицинский академический журнал. – 2019. – T. 19. – № 3. – C. 27–36. [Bunenkov NS, Bunenkova GF, Belyy SA, et al. SAS Enterprise Guide 6.1 for physicians: Getting started. Med Akad Z. 2019;19(3):27-36. (In Russ.)]. https://doi.org/10.17816/MAJ19327-36.
  4. Григорьев С.Г., Лобзин Ю.В., Скрипченко Н.В. Роль и место логистической регрессии и ROC-анализа в решении медицинских диагностических задач // Журнал инфектологии. – 2016. – T. 8. – № 4. – C. 36–45. [Grigor’ev SG, Lobzin YV, Skripchenko NV. The role and place of logistic regressionand ROC analysis in solving medical diagnostic task. Journal Infectology. 2016;8(4):36-45. (In Russ.)]. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2016-8-4- 36-45.
  5. Григорьева Д.В., Горудко И.В., Костевич В.А., и др. Активность миелопероксидазы в плазме крови как критерий эффективности лечения пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями // Биомедицинская химия. – 2016. – T. 62. – № 3. – C. 318–324. [Grigor’eva DV, Gorudko IV, Kostevich VA, et al. Myeloperoxidase activity in blood plasma as a criterion of therapy for patients with cardiovascular disease. Biomed Khim. 2016;62(3):318-324. (In Russ.)]. https://doi.org/10.1134/S1990750816020050.
  6. Панасенко О.М., Михальчик Е.В., Горудко И.В., и др. Влияние антиоксидантов и скавенджеров гипогалоидных кислот на активацию нейтрофилов липопротеинами низкой плотности, модифицированными гипохлоритом // Биофизика. – 2016. – T. 61. – № 3. – C. 500–509. [Panasenko OM, Mikhal’chik EV, Gorudko IV, et al. The effects of antioxidants and hypohalous acid scavengers on neutrophil activation by hypochlorous acid-modified low-density lipoproteins. Biofizika. 2016;61(3):500-509. (In Russ.)]
  7. Соколов А.В., Костевич В.А., Горбунов Н.П., и др. Связь между активной миелопероксидазой и хлорированным церулоплазмином в плазме крови пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями // Медицинская иммунология. – 2018. – T. 20. – № 5. – C. 699–710. [Sokolov AV, Kostevich VA, Gorbunov NP, et al. A link between active myeloperoxidase and chlorinated ceruloplasmin in blood plasma of patients with cardiovascular diseases. Medical Immunology (Russia). 2018;20(5):699-710. (In Russ.)]. https://doi.org/10.15789/1563-0625-2018-5-699-710.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Оценка прогностической ценности тропонина I с помощью логистической регрессии: Death30 — переменная, обозначающая исход операции, 1 — летальный исход, 0 — пациент жив; TnI1 — концентрация тропонина I на 1-й день после операции; CPBTYPE — переменная, кодирующая группу, в данном случае анализ проводится для группы с номером 2

Скачать (172KB)
3. Рис. 2. Результаты логистической регрессии: модель летальные исходы = тропонин I. Чем меньше AIC, –2 Log L, тем более точная модель. Convergence criterion satisfied указывает на значимость построенной модели

Скачать (209KB)
4. Рис. 3. Диагностическая ценность тропонина I в прогнозировании летальных исходов после операций коронарного шунтирования с искусственным кровообращением

Скачать (244KB)
5. Рис. 4. ROC-кривая «хорошего» биомаркера (сплошная линия) и «плохого» биомаркера (пунктирная линия)

Скачать (37KB)
6. Рис. 5. 95 % доверительный интервал для площади под ROC-кривой (Area)

Скачать (63KB)
7. Рис. 6. Критерий Хосмера – Лемешева

Скачать (33KB)
8. Рис. 7. Вычисление верхней границы нормы и индекса Юдена

Скачать (261KB)
9. Рис. 8. Оптимальная точка отсечения (cutoff) и индексы Юдена: prob — вероятность летального исхода при данном значении концентрации тропонина I (cutoff), sensitivity — чувствительность, specifity — специфичность, Youden — индекс Юдена

Скачать (272KB)
10. Рис. 9. Вероятность летального исхода в зависимости от концентрации тропонина I на первые сутки после коронарного шунтирования

Скачать (95KB)

© Буненков Н.С., Буненкова Г.Ф., Комок В.В., Гриненко О.А., Немков А.С., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах