Множественный параллельный анализ экспрессии генов в диагностике рака почки и предстательной железы

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В онкогенезе и прогрессии заболевания участвуют множество генов и сигнальных путей. Понимание молекулярных механизмов, вовлеченных в эти процессы, необходимо для надежной диагностики и успешного лечения онкологических заболеваний. Быстрым и эффективным методом, позволяющим одновременно оценивать экспрессию тысячи генов и выявлять среди них потенциально опухолевоспецифичные. является метод множественного параллельного анализа экспрессии генов (МПАЭ). С целью поиска генов-кандидатов на роль маркеров для диагностики и прогноза течения заболевания, нами были получены профили экспрессии более чем 200 генов, кодирующих протеин-тирозин-киназы и фосфатазы, в опухолевых и нормальных тканях пациентов с раком предстательной железы (РПЖ) и карциномой почки (КП). Среди генов с ярко выраженной экспрессией в нормальной ткани почки, был выявлен ген DUSP9. С целью подтверждения этого феномена, используя метод обратной транскрипции, сопряженной с полимеразной цепной реакцией (ОТ-ПЦР), была проанализирована экспрессия DUSP9 в 26 парных образцах нормальной и опухолевой ткани почки человека. Показано, что КП характеризуется подавлением транскрипции мРНК гена DUSP9 уже на ранних стадиях заболевания. Ген DUSP9 кодирует протеиновую биспецифическую фосфатазу МКР-4. Биологическая роль МКР-4 и инактивация ее экспрессии в процессе карциногенеза свидетельствуют в пользу возможной антион-когенной функции этой фосфатазы. Анализ уровня мРНК другого гена, ADFP, также подтвердил данные МПАЭ об его ассоциации с КП. Увеличение экспрессии ADFP было выявлено у 68% пациентов со светлоклеточной карциномой. Полученные результаты позволяют рассматривать гены DUSP9 и ADFP в качестве потенциальных маркеров для диагностики КП и терапии этого заболевания.

Об авторах

А. М. Гранов

ФГУ «Центральный научно-исследовательский рентгенорадиологический институт Минздравсоцразвития РФ»

Автор, ответственный за переписку.
Email: shabanov@mail.rcom.ru

Академик РАМН

Россия, Санкт-Петербург

Е. И. Якубович

ФГУ «Центральный научно-исследовательский рентгенорадиологический институт Минздравсоцразвития РФ»

Email: shabanov@mail.rcom.ru
Россия, Санкт-Петербург

В. И. Евтушенко

ФГУ «Центральный научно-исследовательский рентгенорадиологический институт Минздравсоцразвития РФ»

Email: shabanov@mail.rcom.ru
Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Князев Ю. П., Чебуркин Ю. В., Спикерманн К. и др. Профили экспрессии протеин-киназ и фосфатаз, полученные с помощью упорядоченных наборов кДНК (КДНК-эррейз): молекулярный портрет рака предстательной железы // Мол. биол. 2003. Т. 37. № 1. С. 97-111.
  2. Чебуркин Ю. В., Князева Т. Г., Петер Ш. и др. Молекулярный портрет карцином почки человека, полученный на основе экспрессии протеинтирозин-киназ и тирозин-фосфатаз, контролирующих передачу регуляторных сигналов в клетках // Мол. биол. 2002. Т. 36. № 3. С. 480-490.
  3. Battagli C., Uzzo R., Dulaimi E. et al. Promoter hypermethylation of tumor suppressor genes in urine from kidney cancer patients // Cancer Res. 2003. Vol. 63. P. 8695-8699.
  4. Boer J., Huber W., Sultmann H. et al. Identification and classification of differentially expressed genes in renal cell carcinoma by expression profiling on a global human 31,5000-element cDNA array // Genome Res. 2001. V. 11. P. 1861-1870.
  5. Bull J. H., Ellison G.. Patel A., Muir G. et al. Identification of potential diagnostic markers of prostate cancer and prostatic intraepithelial neoplasia using cDNA microarray // Br. J. Cancer. 2001. Vol. 84. P. 1512-1519.
  6. Chang L., Karin M. Mammalian MAP kinase signaling cascades // Nature. 2001. Vol. 410. P. 37-40.
  7. Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanatephenol-chloroform extraction // Anal. Biochem. 1987. Vol. 162. P. 156-159.
  8. Dhanasekaran S. M.. Barrette T. R., Ghosh D. et al. Delineation of prognostic biomarkers in prostate cancer // Nature. 2001. Vol. 412. P. 822-825.
  9. Eisen M. Cluster and Tree View. Manual. USA: Standford University, 1998-1999. 21 p.
  10. Galgoczy P., Szafranski K. and Platzer M. Comparative methylation analysis of CpGislands in man and mouse // htpp://www.imbjena.de
  11. Heid H., Moll., Schewetick I. et al. Adipophilin is a specific marker of lipid accumulation in diverse cell types and diseases // Cell Tissue Res. 1998. Vol. 294. P. 309-321.
  12. Landis S. H., Murray T., Bolden S., Wingo P. A. Cancer statistics, 1999 // CA-Cancer J. Clin. 1999. Vol. 49. P. 10-11.
  13. McManaman L., Zabaronick W., Schaack J. et al. Lipid droplet targeting domains of adipophilin // J. Lipid. Res. 2003. Vol. 44. P. 668-673.
  14. Meyer A., Hernandez A., Florl A. et al. Novel mutations of the von Hippel-Lindau tumorsupressor gene and rare DNA hypermethylation in renal-cell carcinoma cell lines of the clear-cell type // Int. J. Cancer. 2000. Vol. 87. P. 650-653.
  15. Muda M., Boschert U., Smith A. et al. Molecular cloning and functional characterization of a novel mitogen activated protein kinase phosphatase, MKP-4 // J. Biol. Chem. 1997. Vol. 272. P. 5141-5151
  16. Pause A., Lee S., Lonergan K. M. and Klausner R. D. The von Hippel-Lindau tumor suppressor gene is required for cell cycle exit upon serum withdrawal // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. Vol. 95. P. 993-998.
  17. Rae F., Stephenson S.-A., Nicol D., Clements J. Novel association of diverse range of genes with renal cell carcinoma as identified by differential display // Int. J. Cancer. 2000. Vol. 88. Р. 726-732.
  18. Sambrook J.. Fritsch E. F. and Maniatis T. Molecular cloning: A laboratory manual/ Cold Spring Harbor. NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. Vol. 1, 2, 3.
  19. Sultmann H., von Heydebreck A., Hube W. et al. Gene expression in kidney cancer is associated with cytogenetic abnormalities, metastasis formation, and patient survival // Clin. Cancer Res. 2005. Vol. 11. P. 646-655.
  20. Theodosiou A., Ashworth A. MAP kinase phosphatases // Genome Biology. 2002. Vol. 3: rewiews 3009.1-3009.10.
  21. Vasseli J. R., Shih J. H., Iyengar S. R. et al. Prediction survival in patients with metastatic kidney cancer by gene expression profiling in the primary tumor // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. Vol. 100. P. 6958-6963.
  22. Weinshenk T., Gouttefangeas C., Schirle M. et al. Integrated functional genomics approach for design of patient-individual antitumor vaccines // Cancer Res. 2002. Vol. 62. P. 5818-5827
  23. Xu J., Stolk J. A., Zhang X. et al. Identification of differentially expressed genes in human prostate cancer using subtraction and microarray // Cancer Res. 2000. Vol. 60. P. 1667-1682.
  24. Yao M., Tabuchi H., Nagashima Y. et al Gene expression analysis of renal carcinoma: adipose differentiation-related protein as a potential diagnostic and prognostic biomarker for clear-cell renal carcinoma // J. Pathol. 2005. Vol. 205. P. 377-387.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Эко-Вектор, 2025


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.