Молекулярная эпидемиология туберкулеза в Баренц-регионе Российской Федерации

Обложка


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В статье описывается молекулярная эпидемиология микобактерий туберкулеза среди новых случаев заболевания туберкулезом в четырех административных территориях Баренц-региона Российской Федерации. С помощью двух методов молекулярной биологии - сполиготипирования и RFLP - установлено, что превалирующим является генотип Beijing (47.1%). Данный генотип обладает самым высоким уровнем кластерности среди всех генотипов, что свидетельствует о его активной передаче. Высокий фитнес МБТ W-Beijing объясняет столь широкое распространение данного генотипа.

Об авторах

А. О. Марьяндышев

ГОУ ВПО «Северный государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию»

Автор, ответственный за переписку.
Email: medaj@eco-vector.com

член-корреспондент РАМН

Россия, 163000, Архангельск

О. С. Тунгусова

ГОУ ВПО «Северный государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию»

Email: medaj@eco-vector.com
Россия, 163000, Архангельск

А. А. Баранов

ГОУ ВПО «Северный государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию»

Email: medaj@eco-vector.com
Россия, 163000, Архангельск

Список литературы

  1. Андреевская С. Н., Черноусова Л. Н., Смирнова Т. Г., Ларионова Е. Е., Кузьмин А. В. Трансмиссия штаммов микобактерий туберкулеза, обусловленная миграционными процессами в Российской Федерации (на примере миграции населения из Кавказского региона в Москву и Московскую область) // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2006. № 1. С. 29-35.
  2. Балабанова Я. М., Николаевский В. В., Радди М. и др. Преобладание штаммов Mycobacterium tuberculosis семейства Beijing и факторы риска их трансмиссии в Самарской области // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2006. № 2. С. 31-37.
  3. Матракшин А. Г., Месько Е. М., Белякова Н. К. идр. Генотипическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis из Республики Тыва // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2004. № 3. С. 37-40.
  4. Медведева Т. В, Огарков О. Б., Некипелов и др. MIRU-VNTR-генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis в Восточной Сибири: семейство Beijing против Kilimanjaro // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. № 4. 2004. С. 33-38.
  5. Нарвская О. В., Мокроусов И. В., Лимещенко Е. В. и др. Характеристика циркулирующих на Северо-Западе России штаммов Mycobacterium tuberculosis с использованием сполиготипирования // Пробл. туб. 2002. № 4. С. 44-47.
  6. Abebe F., Bjune G. The emergence of Beijing family genotypes of Mycobacterium tuberculosis and low-level protection by bacille Calmette - Guerin (BCG) vaccines: is there a link? // Clin. Exp. Immunol. 2006. Sep. Vol. 145. № 3. P. 389-397.
  7. Beijing/W genotype Mycobacterium tuberculosis and drug resistance // Emerg. Infect. Dis. 2006. May. Vol. 12. № 5. P. 736-743.
  8. Billington O. J., McHugh T. D., Gillespie S. H. Physiological cost of rifampin resistance induced in vitro in Mycobacterium tuberculosis // Antimicrobial. Agents. Chemother. 1999. Vol. 43. P. 1866-1869.
  9. Brudey K., Driscoll J. R., Rigouts L. et al. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SpolDB4) for classification, population genetics and epidemiology // BMC Microbiol. 2006. Vol. 6. P. 23.
  10. Cohen T., Sommers B., Murray M. The effect of drug resistance on the fitness of Mycobacterium tuberculosis // Lancet Infect. Dis. 2003. Vol. 3. P. 13-21.
  11. Cole S.T., Brosch R., Parkhill J. et al. Deciphering the biology of Mycobacterium tuberculosis from the complete genome sequence // Nature. 1998. Jun 11. Vol. 393 (6685). P. 537-544.
  12. de Boer A. S., Borgdorff M. W., de Haas P. E. et al. Analysis of rate of change of IS6110 RFLP patterns of Mycobacterium tuberculosis based on serial patient isolates // J. Infect. Dis. 1999. Oct. Vol. 180 (4). P. 1238-1244.
  13. Edlin B. R., Tokars L., Grieco M. H. et al. An outbreak of multidrug-resistant tuberculosis among hospitalized patients with the acquired immunodeficiency syndrome // N. Engl. J. Med. 1992. Jun 4. Vol. 326 (23). P 1514-1521.
  14. Gillespie S. H., Billington O. J., Breathnach A., McHugh T. D. Multiple drug-resistant Mycobacterium tuberculosis: evidence for changing fitness following passage through human hosts // Microb. Drug. Resist. 2002. Vol. 8. P. 273-279.
  15. Gillespie S. H. Evolution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis: clinical and molecular perspective // Antimicrobial. Agents. Chemother. 2002. Vol. 46. P 267-274.
  16. Jonsen P. J., Simonsen G. S., Olsvik Ö. et al. Stability, persistence, and evolution of plasmid-encoded vanA glycopeptide resistance in enterococci in the absence of antibiotic selection in vitro and in gnotobiotic mice // Microb. Drug. Resist. 2002. Vol. 8. P. 161-170.
  17. Kremer K., Arnold C., Cataldi A. et al. Discriminatory power and reproducibility of novel DNA typing methods for Mycobacterium tuberculosis complex strains // J. Clin. Microbiol. 2005. Nov. Vol. 43 (11). P. 5628-5638.
  18. Li Z., Kelley C., Collins F., Rouse D. Expression of katG in Mycobacterium tuberculosis is associated with its growth and persistence in mice and guinea pigs // J. Infect. Dis. 1998. Vol. 177. P. 1030-1035.
  19. Lopez B., Aguilar D., Orozco H. et al. A marked difference in pathogenesis and immune response induced by different Mycobacterium tuberculosis genotypes // Clin. Exp. Immunol. 2003. Jul. Vol. 133(1). P.30-37.
  20. Marttila H. J., Soini H., Vyshnevskaya E. et al. Rapid detection of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis by sequencing and Line probe assay // Scand. J. Infect. Dis. 1998. Vol. 30. P. 129-132.
  21. Morlock G. P., Plikaytis В. B., Crawford J. T. Characterization of spontaneous, in vitro-selected, rifampin-resistant mutants of Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv // Antimicrob. Agents. Chemother. 2000. Vol. 44. P. 3298-3301.
  22. Pyle М. М. Relative numbers of resistant tubercle bacilli in sputa of patients before and during treatment with streptomycin // Proc. Staff. Meet. Mayo. Clin. 1947. Vol. 22. P. 465-473.
  23. Rossau R., Traore H., de Beenhouwer H. et al. Evaluation of the INNO-LiPA Rif. ТВ assay, a reverse hybridization assay for the simultaneous detection of Mycobacterium tuberculosis complex and its resistance to rifampin // Antimicrob. Agents. Chemother. 1997. Vol. 41. P. 2093-2098.
  24. Spoligotyping kit manual // Isogen Life Science. 2005.
  25. Toungoussova O. S., Caugant D. A., Sandven P. et al. Impact of drug resistance on fitness of Mycobacterium tuberculosis strains of the W-Beijing genotype // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2004. Nov. 1. Vol. 42 (3). P. 281-290.
  26. Toungoussova O. S., Mariandyshev A., Bjune G. et al. Molecular epidemiology and drug resistance of Mycobacterium tuberculosis isolates in the Archangel prison in Russia: predominance of the W-Beijing clone family // Clin. Infect. Dis. 2003. Sep. 1. Vol. 37 (5). P. 665-672.
  27. Toungoussova O. S., Sandven P., Mariandyshev A. O. et al. Spread of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype in the Archangel Oblast, Russia // J. Clin. Microbiol. 2002. Jun. Vol. 40 (6). P. 1930-1937.
  28. Van S. D. Molecular epidemiology of tuberculosis and other mycobacterial infections: main methodologies and achievements // J. Intern. Med. 2001. Jan. Vol. 249 (1). P. 1-26.
  29. WHO. Global tuberculosis control: surveillance, planning, financing: WHO report 2006. Geneva: World Health Organization. 2006.
  30. WHO. The world health report 2004: changing history. Geneva: World Health Organization. 2004.
  31. WHO. Tuberculosis fact sheet № 104. 2006. Mar.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Марьяндышев А.О., Тунгусова О.С., Баранов А.А., 2007



СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.