Величественный ландшафт мегасистемы эукариот

Полный текст

ВВЕДЕНИЕ

Обзор базовых подразделений системы живого, начиная с работ Э. Геккеля [1–4], привлекал внимание ряда авторов, склонных как к «обобщению обобщений», так и дидактическим решениям, помогающим новым поколениям биологов уяснить современные представления о разнообразии и дивергенции основных групп органического мира. Наиболее известными в этой области именами являются Э. Шаттон [5], Х. Коупленд [6], М. Шадфо [7], Джеффри [8], А. Л. Тахтаджян [9], Л. Маргелис [10], Кавалье-Смит [11], а среди имен отечественных специалистов можно упомянуть П. Ф. Горянинова [12], О. Г. Кусакина, Я. И. Старобогатова [13], Л. Н. Серавина [14], С. А. Карпова [15]. В последние годы, когда под классификацию было подведено прочное основание молекулярной систематики, новая стабильная генеалогическая система эукариот стала востребована практиками, поскольку легко позволяет ориентироваться в разнообразии микроорганизмов. Однако, процедура оценки «таксономического расстояния» между сестринскими группами пока еще не отработана, поскольку новейшие исследования так или иначе «центрированы» определенной группой организмов, а общая выборка таксонов, в которой проведены полногеномные исследования, дает картину, изобилующую многочисленными пробелами.

ИЗЛОЖЕНИЕ ОСНОВНОГО МАТЕРИАЛА

В декабре 2022 г. увидела свет написанная на английском языке монография И. В. Змитровича, В. В. Перелыгина и М. В. Жарикова «Номенклатура и ранговая корреляция высших таксонов эукариот» [16], в которой дана смелая попытка обзора всего, что накопилось в области мегаклассификации эукариот начиная от Шаттона, впервые формально описавшего группу эукариот, до работ по мегасистематике эукариот 2022 г. Кроме того, авторы дают свою версию системы эукариот, в которой у ряда групп понижен таксономический ранг и формально описаны такое царство как Crumalia (латинизированное название клады CRuMS), и типов Mantamonadea, Rigifilidea и Collodictyonidea. Книга ценна не только как хороший обзор, но и глубиной обсуждения актуальных вопросов классификации эукариот.

Структура книги довольно интересна. Примерно треть текста занимает основное содержание, разбитое на предисловие, введение, четыре главы и заключение, треть книги – обширный список литературы (356 источников), и треть – вспомогательный аппарат (примечания и приложение – конспект основных систем эукариот, публиковавшихся в период с 1925 по 2022 гг.).

В Предисловии авторы пишут о важной – интегрирующей знание – функции мегасистематики в развитии теоретической биологии и связанных с ней практических дисциплин. Действительно, по словам академика А. Л. Тахтаджяна, систематика является и фундаментом, и венцом биологии [17].

Введение обширно и содержит как общую характеристику эукариот, так и вынесенные в отдельные подразделы исторический очерк систематики, интересный подраздел о «редукционистских жестах» в систематике, подраздел о «молекулярной революции», о крупных группах эукариот в современном понимании, а также о пионерах в области формализации ранговой структуры высших таксонов эукариот – Я. И. Старобогатове, О. Г. Кусакине и А. Л. Дроздове.

Глава 1. «Номенклатурные принципы и метод презентации» (Nomenclatural principles and method of presentation) посвящена краткому обзору положений Международного кодекса зоологической номенклатуры и Международного кодекса ботанической номенклатуры, в той или иной мере полезных для унификации номенклатуры высших таксонов эукариот. Следует отметить, что эти кодексы практически не регламентируют номенклатурные решения выше ранга отдела (ботанический кодекс), поэтому опираться часто можно не на их «букву», а скорее на «дух» (т. е. по аналогии с четко регламентируемыми ими номенклатурными решениями). Вторая часть главы посвящена объяснению приемов подачи материала, которые будут использованы авторами в следующей главе.

Глава 2. «Авторский обзор текущей системы эукариот» (Authors’ overview of the current eukaryotic system) представляет конспект иерархической системы эукариот, в котором отображается как соподчиненность таксонов в качестве субклад (отображается определенным количеством заштрихованных кружочков), так и отсылка к рангу, в котором эти таксоны рекомендуется рассматривать. Маргиналии содержат ценную информацию о первоисточнике, в котором тот или иной таксон описан (наличие таких отсылок делает работу ценным справочником). Наиболее крупными подразделениями системы, принятой авторами, являются:

• OBIMODA
• •Loukozoa
• •Amoebozoa
• •Obazoa
• ••Opisthokonta
• ••Breviatea
• ••Apusomonadida
• •Crumalia
• DIPHODA
• •Discoba
• •Plantae
• ••Cryptista
• ••Archaeplastida
• •Haptista
• •Chromalveolata
• ••Eochromista
• •••Telonemia
• •••Hemimastigophora
• •••Provora
• ••Rhizaria
• ••Alveolata
• ••Heterokonta

Глава 3. «Неопределенное будущее мегасистематики эукариот» (Uncertain futures of eukaryotic megasystematics) представляет с одной стороны философское эссе, посвященное разговору о состоянии знаний о «корне эукариот», а с другой – футурологический очерк, в котором рассматриваются противоречивые тренды современного мейнстрима в области мегаклассификации. Авторы приходят к выводу, что системы, созданные большими группами авторов-специалистов, издаваемые в высокорейтинговых журналах, будут задавать основной тренд и эти системы – со всеми их преимуществами и недостатками – будут переходить и в дидактическую литературу, при этом определенную роль могут играть и стабильные Интернет-классификаторы. В качестве примера последнего авторы приводят созданный ими в 2022 г. сайт «Eukaryotic supergroups: Taxonomy/Biotechnology interface».

Глава 4. «Флора», «фауна», «фунга»: воздействие дискуссии в мегасистематики на флористическую и фаунистическую терминологию» («Flora», «Fauna», «Funga»: an impact of discussion in megataxonomy on the floristic and faunistic terminology) на примере вынесенных в название главы терминов показывает, как «работает» мейнстрим и как трудно бывает, казалось бы, логичным инновациям «пробиться» сквозь «броуновское движение» повседневных представлений. Ценность главы состоит в том, что в отдельную таблицу аккуратно собраны ссылки на различные «флористические» и «фаунистические» трактовки таких групп как грибы, слизевики, эвгленовые и прочие «растительные жгутиконосцы».

Заключение емко обобщает непростой материал, собранный в этой монографии, но на нем содержательный посыл этого труда не заканчивается. Очень интересны послетекстовые примечания, среди которых встречаются и «мини-произведения». Так, в первом же примечании оценивается роль русского ботаника П. Ф. Горянинова в развитии клеточной теории – этого мы не найдем в современных учебных пособиях. Одна из заметок посвящена интересной и ныне почти забытой «флоридейной» гипотезе происхождения грибов. Наконец, большая заметка посвящена характеристике группы оомицетов в исторической перспективе. Не менее интересно и собрание мегасистем эукариот, вынесенное в Приложение. Листая эту часть книги, читатель оказывается в калейдоскопически сменяющих друг друга ландшафтах теоретической биологии, а, вместив этот массив данных, сам становится «немного мегасистематиком».

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Как отмечал один из рецензентов данной монографии М. В. Архипов, следующим этапом проведенной авторами работы могут быть дальнейшие исследования по разработке алгоритмов управления микробным сообществом в условиях различных типов сред обладающих разной совокупностью лимитирующих факторов при реализации полезных свойств микроорганизмов обладающих различной секреторной активностью [18].

Другой рецензент, В. Г. Лужанин, также надеется, что проведенное авторами большое теоретическое исследование – это лишь пролегомены, рассчитанные на дискуссию в фундаментальной таксономической области, а в дальнейшем ими будет сделан шаг навстречу русскоязычному читателю, причем как в сторону популяризации собранного уникального материала, так и его приближения к практике – раскрытию богатейшего биотехнолгического потенциала различных «крупных групп» эукариот [19]. Не зря открывает рецензируемую монографию портрет профессора Ксении Мироновны Сухановой, замечательного ученого, педагога, внесшего неоценимый вклад в изучение цитологии и поведения эвгленид и инфузорий, а также ключевого автора не имеющего аналогов в мире практического пособия «Фауна аэротенков», увидевшего свет в 1984 г. [20]. Первые шаги в этом направлении авторами уже сделаны [21] и мы надеемся, что уже в ближайшее время авторский коллектив выпустит ориентированное на биотехнологическое сообщество пособие, описывающее современную сбалансированную систему, биоразнообразие, особенности секретома крупных групп низших эукариот.

Об авторах

Йована Владимировна Стругар

Санкт-Петербургский государственный химико-фармацевтический университет Министерства здравоохранения Российской Федерации

Автор, ответственный за переписку.
Email: iovana.strugar@spcpu.ru

канд. фармацевт. наук, старший преподаватель Института международных образовательных программ

Россия, Санкт-Петербург

Михаил Владимирович Томусяк

Санкт-Петербургский государственный химико-фармацевтический университет Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: tomusyak.mihail@spcpu.ru

магистрант кафедры промышленной экологии

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

Дополнительные файлы