The ITS1-5.8S rRNA gene -ITS2 sequence variability during the divergence of sweet-grass species (gen us Glyceria R. Br.)
- Authors: Rodionov A.V1, Kotsinyan A.R1, Gnutikov A.A1, Dobroradova M.A2, Machs E.M1
-
Affiliations:
- V. L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, RF
- Saint-Petersburg State University., Saint-Petersburg, RF
- Issue: Vol 9, No 4 (2011)
- Pages: 63-69
- Section: Articles
- URL: https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/article/view/5781
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen9463-69
- ID: 5781
Cite item
Full Text
Abstract
Keywords
About the authors
Alexander V Rodionov
V. L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, RF
Email: avrodionov@mail.ru
Armen R Kotsinyan
V. L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, RF
Email: avrodionov@mail.ru Professora Popova st., 2., St.Petersburg, 197376, Russia
Alexander A Gnutikov
V. L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, RF
Email: avrodionov@mail.ru Professora Popova st., 2., St.Petersburg, 197376, Russia
Marina A Dobroradova
Saint-Petersburg State University., Saint-Petersburg, RF
Email: avrodionov@mail.ru 7-9, Universitetskaya nab., St.Petersburg, 199034, Russia
Eduard M Machs
V. L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, RF
Email: Professora Popova st., 2., St.Petersburg, 197376, Russia
References
- Ким Е. С., Большева Н. Л., Саматадзе Т. Е. и др., 2009. Уникальный геном двухромосомных злаков Zingeria и Colpodium, его происхождение и эволюция // Генетика. Т. 45. С. 1506-1515.
- Комаров В. Л., 1934. Род 176. Манник - Glyceria R. Br. // Флора СССР. Т. 2 / Ред. В. Л. Комаров, Ленинград: Издательство Академии наук СССР. С. 449- 460.
- Родионов А. В., Ким Е. С., Носов Н. Н. и др., 2008. Молекулярно-филогенетическое исследование видов рода Colpodium sensu lato (Poeae, Poaceae) // Экологическая генетика. Т. 6. № 4. С. 34-46.
- Родионов А. В., Тюпа Н. Б., Ким Е. С. и др., 2005. Геномная конституция автотетраплоидного овса Avena macrostachya, выявленная путем сравнительного анализа последовательностей ITS1 и ITS2: к вопросу об эволюции кариотипов овсов и овсюгов на ранних этапах дивергенции видов рода Avena // Генетика. Т. 41. C. 646-656.
- Цвелев Н. Н., 2006. Краткий обзор рода манник Glyceria (Poaceae) // Бот. журн. Т. 91. С. 255-276.
- Шнеер В. С., 2009. ДНК штрихкодирование - новое направление в сравнительной геномике растений // Генетика. Т. 54. С. 1436-1448.
- Alvarez A. E., Wendel J. F., 2003. Ribosomal ITS sequences and plant phylogenetic inference // Molec. Phylogenet. Evol. Vol. 29. P. 417-434.
- Calonje M., Martin-Bravo S., Dobeš C. et al., 2009. Non-coding nuclear DNA markers in phylogenetic reconstruction // Plant Syst. Evol. Vol. 282. P. 257-280.
- Charch G. L., 1949. A cytotaxonomic study of Glyceria and Puccinellia// Am. J. Bot. Vol. 36. P. 155- 165.
- Coleman A. W., 2009. Is there a molecular key to the level of "biological species" in eukaryotes? A DNA guide // Molec. Phylogenet. Evol. Vol. 50. P. 197- 203.
- Gillespie L. J., Archambault A., Soreng R. J., 2007. Phylogeny of Poa (Poaceae) based on trnT-trnP sequence data: major clades and basal relationships // Monocots: comparative biology and evolution-Poales. /Eds. J. T. Columbus, E. A. Friar, J. M. Porter et al. Claremont, Calif.: Rancho Santa Ana Botanic Garden. P. 420-434.
- Koš M., Tollervey D., 2010. Yeast pre-rRNA processing and modification occur cotranscriptionally // Mol. Cell. Vol. 37. P. 809-820.
- Mejia-Saules T., Bisby F., 2000. A. preliminary views on the tribe Meliceae (Gramineae: Pooideae) // Grasses: systematics and evolution / Eds. S. W. L. Jacobs, J. Everett. Collingwood, VIC, Australia: CSIRO Publishing. P. 83-88.
- Nieto Feliner G., Rosello J. A., 2007. Better the devil you know? Guidelines for insightful utilization of nrDNA ITS in species-level evolutionary studies in plants // Molec. Phylogenet. Evol. Vol. 44. P. 911-919.
- Ridgway K. P., Duck J. M., Young J. P. W., 2003. Identification of roots from grass swards using PCR RFLP and FFLP of the plastid trnL (UAA) intron // BMC Ecol. Vol. 3. P. 8.
- Schneider J., Doring E., Hilu K. W., Roser M. 2009. Phylogenetic structure of the grass subfamily Pooideae based on comparison of plastid matK gene-3' trnK exon and nuclear ITS sequences // Taxon. Vol. 58. P. 405- 424.
- Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S., 2007. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) soft ware version 4.0 // Mol. Biol. Evol. Vol. 24. P. 1596- 1599.
- Tzvelev N. N., 1989. The system of Grasses (Poaceae) and their evolution // Botanical Review. Vol. 55. P. 141- 203.
- Whipple I. G., Barkworth M. E., Bushman B. S., 2007. Molecular insights into the taxonomy of Glyceria (Poaceae: Meliceae) in North America // Am. J. Bot. Vol. 94. P. 551-557.
- White T. J., Bruns T., Lee S., Taylor J., 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics // PCR Protocols: a Guide to Methods and Applications / Eds M. A. Innis, D. H. Gelfand,J. J. Sninsky, T. J. White. San Diego: Academic Press Inc. P. 315-322.