Моделирование связывания лигандов в “кислотном кармане” протонактивируемого ионного канала ASIC1a
- Авторы: Коркош В.С.1, Тихонов Д.Б.1
-
Учреждения:
- Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова Российской Академии наук
- Выпуск: Том 485, № 2 (2019)
- Страницы: 234-237
- Раздел: Биохимия, биофизика, молекулярная биология
- URL: https://journals.eco-vector.com/0869-5652/article/view/12859
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0869-56524852234-237
- ID: 12859
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Осуществили докинг ряда лигандов ионного канала ASIC1a, оказывающих потенцирующее или ингибирующее действие за счёт стабилизации открытого и закрытого состояний. Впервые показали, как направленность действия может зависеть от трёхмерной структуры лиганда. Потенциаторы и ингибиторы по-разному взаимодействуют с аминокислотными остатками так называемого кислотного кармана, где происходит связывание протонов. Полученные результаты открывают возможность для теоретического дизайна новых фармакологических агентов.
Об авторах
В. С. Коркош
Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова Российской Академии наук
Автор, ответственный за переписку.
Email: denistikhonov2002@yahoo.com
Россия, Санкт-Петербург
Д. Б. Тихонов
Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова Российской Академии наук
Email: denistikhonov2002@yahoo.com
член-корреспондент РАН
Россия, Санкт-ПетербургСписок литературы
- Baron A., Lingueglia E. // Neuropharmacology. 2015. V. 94. P. 19-35.
- Yoder N., Yoshioka C., Gouaux E. // Nature. 2018. V. 55. № 7696. P. 397-401.
- Gonzales E. B., Kawate T., Gouaux E. // Nature. 2009. V. 460. № 7255. P. 599-604.
- Baconguis I., Gouaux E. // Nature. 2012. V. 489. № 7416. P. 400-405.
- Baconguis I., Bohlen C. J., Goehring A., Julius D., Gouaux E. // Cell. 2014. V. 156. № 4. P. 717-729.
- Tikhonov D.B., Zhorov B.S. // J. Gen. Physiol. 2017. V. 149. № 4. P. 465-481.
- Nagaeva E. I., Potapieva N. N., Nikolaev M. V., Gmiro V. E., Magazanik L. G., Tikhonov D. B. // Eur. J. Pharmacol. 2016. V. 788. P. 75-83.
- Nagaeva E. I., Tikhonova T. B., Magazanik L. G., Tikhonov D. B. // Neurosci. Lett. 2016. V. 632. P. 136-140.
- Alijevic O., Hammoud H., Vaithia A., Trendafilov V., Bollenbach M., Schmitt M., Bihel F., Kellenberger S. // ACS Chem. Neurosci. 2018. V. 9. P. 1357-1365.
- Alijevic O., Kellenberger S. // J. Biol. Chem. 2012. V. 287. № 43. P. 36 059-36 070.
- Tikhonova T. B., Nagaeva E. I., Barygin O. I., Po- tapieva N. N., Bolshakov K. V., Tikhonov D. B. // Neuropharmacology. 2015. V. 89. P. 1-10.