Fluorescent DNA probes: properties study and methods of application
- Authors: Sibirtsev V.S.1, Garabadgiu A.V.2, Shvets V.I.2,3
-
Affiliations:
- FSBSI ARRI Food Additives, a Branch of the FSBSI “FSC for Food Systems named after V.M. Horbatov”
- St.Petersburg State Technological Institute
- "MIREA-Russian Technological University"
- Issue: Vol 489, No 5 (2019)
- Pages: 530-534
- Section: Biochemistry, biophysics, molecular biology
- URL: https://journals.eco-vector.com/0869-5652/article/view/18853
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0869-56524895530-534
- ID: 18853
Cite item
Full Text
Abstract
The results of long-term author’s studies of the optical and complex-forming properties of more than 30 synthetic low-molecular-weight fluorophores specific for DNA are described. These studies have significantly expand the already existing database of properties of such compounds and clarify ideas about the patterns linking the mentioned properties of fluorophores with their structure, and formulate recommendations on the design of new, effective, DNA‑specific fluorophores. The results of these studies can be used, in particular, in the development of new express methods for diagnosing various diseases biotesting of pro- and antibiotic properties of various products and wastes, etc.
Keywords
About the authors
V. S. Sibirtsev
FSBSI ARRI Food Additives, a Branch of the FSBSI “FSC for Food Systems named after V.M. Horbatov”
Author for correspondence.
Email: vs1969r@mail.ru
Russian Federation, 55, Liteinyi prospect, Moscow, 191014
A. V. Garabadgiu
St.Petersburg State Technological Institute
Email: vs1969r@mail.ru
Russian Federation, 26, Moskovskii prospect, St. Petersburg, 198013
V. I. Shvets
St.Petersburg State Technological Institute; "MIREA-Russian Technological University"
Email: vs1969r@mail.ru
Academician of the Russian Academy of Sciences
Russian Federation, 26, Moskovskii prospect, St. Petersburg, 198013; 78, Vernadskogo prospect, Moscow, 119454References
- Сибирцев В.С., Гарабаджиу А.В., Иванов С.Д. Механизмы изменения флуоресцентных свойств бисбензимидазольных красителей // Биоорган. химия. 1995. Т. 21. № 9. С. 731-736.
- Сибирцев В.С., Гарабаджиу А.В., Иванов С.Д. Спектральные свойства красителей бисбензимидазольного ряда при взаимодействии с ДНК // Биоорган. химия. 1997. Т. 23. № 12. С. 969-978.
- Сибирцев В.С., Гарабаджиу А.В. Влияние природы гетероатома в бензазолах на их спектральные свойства // Журн. органической химии. 1997. Т. 33. № 12. С. 1840-1843.
- Сибирцев В.С., Глибин Е.Н., Иванов С.Д. Изменения спектральных свойств производных актиноцина, обусловленные превращением равновесных форм // Журн. органической химии. 2000. Т. 36. № 12. С. 1865-1872.
- Сибирцев В.С., Гарабаджиу А.В., Иванов С.Д. Сравнительное исследование свойств ДНК специфичных красителей индольного и бензимидазольного ряда // Биоорганическая химия. 2001. Т. 27. № 1. С. 64-73.
- Сибирцев В.С., Толмачев А.Ю., Суслов В.В., Гарабаджиу А.В., Травень В.Ф. Зависимость флуоресцентных свойств соединений псораленового, ангелицинового и карбазольного рядов от характера их терминальных заместителей // Журн. органич. хим. 2003. Т. 39. № 6. С. 930-938.
- Сибирцев В.С. Изучение возможностей применения к анализу ДНК бифункциональной системы: бромид этидия + Хехст 33258 // Биохимия. 2005. Т. 70. № 4. С. 545-555.
- Сибирцев В.С., Толмачев А.Ю., Ковалева М.В., Гарабаджиу А.В., Травень В.Ф. Спектральное исследование взаимодействия с ДНК 4,8,4’-триметилпсораленов и 4,4’-диметилангелицинов // Биохимия. 2005. Т. 70. № 7. С. 995-1007.
- Сибирцев В.С., Гарабаджиу А.В. Флуоресцентные ДНК зонды: введение в теорию и практику использования. СПб.: НОУ “Экспресс”, 2006. 188 с.
- Сибирцев В.С. Флуоресцентные ДНК зонды: исследование механизмов изменения спектральных свойств и особенностей практического применения // Биохимия. 2007. T. 72. № 8. С. 1090-1106.
- Сибирцев В.С., Гарабаджиу А.В. Спектральное исследование взаимодействия с ДНК бензтиазолил-бенз-α-хромена // Биохимия. 2007. T. 72. № 8. С. 1107-1116.
- Сибирцев В.С. Исследование механизмов изменения спектральных свойств при взаимодействии с ДНК соединений бензазольного, индольного и фенантридиумного рядов // Оптический журнал. 2017. Т. 84. № 5. С. 13-21.
- Сибирцев В.С. Методики биотестирования на основе флуорометрического геномного анализа // Оптич. журн. 2017. Т. 84. № 11. С. 84-89.