Особенности кишечной микробиоты пациентов с диспепсией

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Введение. Изучение связи функциональной диспепсии с кишечной микробиотой даст понимание роли отдельных микроорганизмов, а также продуктов их метаболизма в развитии данной патологии.

Целью исследования был анализ микробиоты пациентов с диагнозом функциональная диспепсия.

Материал и методы. С помощью платформы Ion Torrent PGM было проведено секвенирование участка V3 гена 16S rRNA.

Результаты. Дифференциальный анализ численности показал, что у пациентов с диспепсией в кишечнике присутствуют бактерии Corynebacterium jeikeium и Eggerthella lenta, которые ранее были ассоциированы с рядом воспалительных заболеваний. Установлена связь бактерий Erysipelotrichaceae UCG-003 bacterium, Fusicatenibacter saccharivorans и Turicibacter sanguinis с диспепсией.

Заключение. Изучены особенности фекальной микробиоты пациентов с диспепсией. Полученные результаты показали взаимосвязь отдельных видов с данной патологией. Впервые показана взаимосвязь видов Erysipelotrichaceae UCG-003 bacterium, Fusicatenibacter saccharivorans и Turicibacter sanguinis с функциональной диспепсией.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Инна Юрьевна Буракова

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет инженерных технологий»

Автор, ответственный за переписку.
Email: vitkalovai@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-5881-0845

младший научный сотрудник лаборатории метагеномики и пищевых биотехнологий

Россия, 394036, Воронеж, Проспект Революции, д. 19

Мария Владимировна Грязнова

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет инженерных технологий»

Email: mariya-vg@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-2076-3868

младший научный сотрудник лаборатории метагеномики и пищевых биотехнологий

Россия, 394036, Воронеж, Проспект Революции, д. 19

Юлия Дмитриевна Смирнова

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет инженерных технологий»

Email: dyd16@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5820-1804

младший научный сотрудник лаборатории метагеномики и пищевых биотехнологий

Россия, 394036, Воронеж, Проспект Революции, д. 19

Полина Дмитриевна Морозова

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет инженерных технологий»; ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет»

Email: ms.cloud00.00@mail.ru
ORCID iD: 0009-0000-0075-9170

инженер лаборатории метагеномики и пищевых биотехнологий; студент кафедры генетики, цитологии и биоинженерии

Россия, 394036, Воронеж, Проспект Революции, д. 19; 394018, Воронеж, Университетская площадь, д. 19

Павел Андреевич Чижков

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет»

Email: qooleer@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5626-0579

аспирант III курса медико-биологического факультета кафедры генетики, цитологии и биоинженерии

Россия, 394018, Воронеж, Университетская площадь, д. 19

Светлана Николаевна Лагутина

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный медицинский университет им. Бурденко»

Email: svlagutina97@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-3730-5265

ассистент кафедры поликлинической терапии

Россия, 394036, Воронеж, ул. Студенческая, 10

Михаил Юрьевич Сыромятников

ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет инженерных технологий»; ФГБОУ ВО «Воронежский государственный университет»

Email: mihan.vrn@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9028-0613

ведущий научный сотрудник лаборатории метагеномики и пищевых биотехнологий; доцент кафедры генетики, цитологии и биоинженерии, кандидат биологических наук, доцент

Россия, 394036, Воронеж, Проспект Революции, д. 19; 394018, Воронеж, Университетская площадь, д. 19

Список литературы

  1. Karakan T., Ozkul C., Küpeli Akkol E., Bilici S., Sobarzo-Sánchez E., Capasso R. Gut-Brain-Microbiota Axis: Antibiotics and Functional Gastrointestinal Disorders. Nutrients. 2021; 13 (2): 389. doi: 10.3390/nu13020389.
  2. Du L.J., Chen B.R., Kim J.J., Kim S., Shen J.H., Dai N. Helicobacter pylori eradication therapy for functional dyspepsia: Systematic review and meta-analysis. World J. Gastroenterol. 2016; 22 (12): 3486–95. doi: 10.3748/wjg.v22.i12.3486.
  3. Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Маркелова М.И., Григорьева Т.В., Булыгина Е.А., Маланин С.Ю., Васильев И.Ю., Синягина М.Н., Абдулхаков Р.А., Киясов И.А. Изменения таксономического состава микробиоты кишечника под влиянием эрадикационной терапии Helicobacter pylori. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2018; 159 (11): 48–61. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-159-11-48-61. [Safina D.D., Abdulkhakov S.R., Markelova M.I., Grigoryeva T.V., Boulygina E.A., Malanin S.Yu., Vasilyev I.Yu., Siniagina M.N., Abdulkhakov R.A., Kiyasov I.A. Changes in the taxonomic composition of the intestinal microbiota under the influence of Helicobacter pylori eradication therapy. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2018; 159 (11): 48–61 (in Russian)]
  4. Серкова М.Ю., Павлова Е.Ю., Оганезова И.А. Функциональная диспепсия и кишечная микробиота: возможна ли взаимосвязь? Фарматека. 2018; 13: 23. doi: 10.18565/pharmateca.2018.13.23-29. [Serkova M.Yu., Pavlova E.Yu., Oganezova I.A. Functional dyspepsia and intestinal microbiota: is a relationship possible? Pharmateka. 2018; 13: 23 (in Russian)]
  5. Koloski N.A., Jones M., Talley N.J. Evidence that independent gut-to-brain and brain-to-gut pathways operate in the irritable bowel syndrome and functional dyspepsia: a 1-year population-based prospective study. Aliment Pharmacol Ther. 2016; 44 (6): 592–600. doi: 10.1111/apt.13738.
  6. Ивашкин В.Т., Маев И.В., Шептулин А.А., Лапина Т.Л., Трухманов А.С., Картавенко И.М., Киприанис В.А., Охлобыстина О.З. Клинические рекомендации Российской гастроэнтерологической ассоциации по диагностике и лечению функциональной диспепсии. Рос журн гастроэнтерол гепатол колопроктол 2017; 27 (1): 50–61. doi: 10.22416/1382-4376-2017-27-1-50-61 [Ivashkin V.T., Mayev I.V., Sheptulin A.A., Lapina T.L., Trukhmanov A.S., Kartavenko I.M., Kiprianis V.A., Okhlobystina O.Z. Diagnosis and treatment of the functional dyspepsia: clinical guidelines of the Russian Gastroenterological Association. Ross z gastroentrerol gepatol koloproktol 2017; 27 (1): 50–61 (In Russ.)]
  7. Ai D., Pan H., Li X., Gao Y., Liu G., Xia L.C. Identifying Gut Microbiota Associated With Colorectal Cancer Using a Zero-Inflated Lognormal Model. Front Microbiol. 2019; 10: 826. doi: 10.3389/fmicb.2019.00826.
  8. Wang T., Cai G., Qiu Y., Fei N., Zhang M., Pang X., Jia W., Cai S., Zhao L. Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers. ISME J. 2012; 6 (2): 320–9. doi: 10.1038/ismej.2011.109.
  9. Martin R., Bermúdez-Humarán L.G., Langella P. Searching for the Bacterial Effector: The Example of the Multi-Skilled Commensal Bacterium Faecalibacterium prausnitzii. Front Microbiol. 2018; 9: 346. doi: 10.3389/fmicb.2018.00346.
  10. Takeshita K., Mizuno S., Mikami Y., Sujino T., Saigusa K., Matsuoka K., Naganuma M., Sato T., Takada T., Tsuji H., Kushiro A., Nomoto K., Kanai T. A Single Species of Clostridium Subcluster XIVa Decreased in Ulcerative Colitis Patients. Inflamm Bowel Dis. 2016; 22 (12): 2802–10. doi: 10.1097/MIB.0000000000000972.
  11. Cotozzolo E., Cremonesi P., Curone G., Menchetti L., Riva F., Biscarini F., Marongiu M.L., Castrica M., Castiglioni B., Miraglia D., Luridiana S., Brecchia G. Characterization of Bacterial Microbiota Composition along the Gastrointestinal Tract in Rabbits. Animals (Basel). 2020; 11 (1): 31. doi: 10.3390/ani11010031.
  12. Kalyana Chakravarthy S., Jayasudha R., Ranjith K., Dutta A., Pinna N.K., Mande S.S., Sharma S., Garg P., Murthy S.I., Shivaji S. Alterations in the gut bacterial microbiome in fungal Keratitis patients. PloS one. 2018; 13 (6): e0199640. doi: 10.1371/journal.pone.0199640.
  13. Gargari G., Mantegazza G., Cremon C., Taverniti V., Valenza A., Barbaro M.R., Marasco G., Duncan R., Fiore W., Ferrari R., De Vitis V., Barbara G., Guglielmetti S. Collinsella aerofaciens as a predictive marker of response to probiotic treatment in non-constipated irritable bowel syndrome. Gut Microbes. 2024; 16 (1): 2298246. doi: 10.1080/19490976.2023.2298246.
  14. Ракова Е.Б., Немченко У.М., Попкова С.М., Сердюк Л.В., Долгих В.В., Иванова Е.И., Савелькаева М.В. Видовая характеристика бифидобактерий в кишечном биотопе детей с функциональной диспепсией. Клиническая лабораторная диагностика. 2015; 60 (10): 50–3. Rakova E.B., Nemchenko U.M., Popkova S.M., Serdyuk L.V., Dolgikh V.V., Ivanova E.I., Savelkaeva M.V. Species characteristics of bifidobacteria in the intestinal biotope of children with functional dyspepsia. Clinical laboratory diagnostics. 2015; 60 (10): 50–3 (in Russian).
  15. Zhang, Y., Fan, K., Li, L., He, J., Sun, Y. Peptostreptococcus anaerobius is a potential diagnostic biomarker of colorectal cancer. Cellular and Molecular Biology. 2023; 69 (10): 244–7. doi: 10.14715/cmb/2023.69.10.36.
  16. Tas A., Köklü S., Yüksel I., Başar O., Akbal E., Cimbek A. No significant association between halitosis and upper gastrointestinal endoscopic findings: a prospective study. Chin Med J. (Engl). 2011; 124 (22): 3707–10.
  17. Ugarte-Torres A., Gillrie M.R., Griener T.P., Church D.L. Eggerthella lenta Bloodstream Infections Are Associated With Increased Mortality Following Empiric Piperacillin-Tazobactam (TZP) Monotherapy: A Population-based Cohort Study. Clin Infect Dis. 2018; 67 (2): 221–8. doi: 10.1093/cid/ciy057. PMID: 29373647.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Особенности микробиоты фекалий пациентов с диспепсией на уровне типа

Скачать (64KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Показатели α-разнообразия микробиоты пациентов с диспепсией и здоровой группы

Скачать (70KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Показатель β-разнообразия микробиоты пациентов с диспепсией и здоровой группы

Скачать (55KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Особенности микробиоты у пациентов с диспепсией

Скачать (119KB)
Метаданные

© ИД "Русский врач", 2025