ПРИМЕНЕНИЕ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ПРИ МОНИТОРИНГЕ ЭНТЕРОВИРУСОВ -ВОЗБУДИТЕЛЕЙ СЕРОЗНОГО МЕНИНГИТА


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

В течение 2007—2011 гг. проводился мониторинг возбудителей энтеровирусного менингита в Нижегородской области с использованием молекулярно-генетических методов. С помощью частичного секвенирования области VP1 генома были исследованы образцы от 226 больных серозным менингитом с положительним результатом ПЦР-исследования на жтеровируси. Генотип жтеровируса бил установлен в 68,14% случаев. С использованием молекулярного и вирусологического методов било идентифицировано 316 энтеровирусов, принадлежащих 22 типам 4 видов — А (0,3%), В (98,4%), С(1%) и D (0,3%). Изучена генетическая гетерогенность, филогения и особенности молекулярной эпиидемиологии вирусов ЕСНО 30, ЕСНО 9, Коксаки А9 и ЕСНО 6, доминировавших среди возбудителей энтеровирусного менингита в Нижегородской области в исследуемий период.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Людмила Николаевна ГОЛИШНА

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора

Email: mevirfc@rambler.ru
канд. биол. наук, вед. науч. сотр. 603950, Нижний Новгород, ул. Грузинская, д. 44

Светлана Григорьевна ФОМИНА

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора

Email: mevirfc@rambler.ru
науч. сотр. Нижний Новгород

Ольга Владимировна ПАРФЕНОВА

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора

Email: prokaids@sinn.ru
канд. биол. наук, биолог Нижний Новгород

Людмила Львовна КЛИМОВА

Центр гигиены и эпидемиологии в Нижегородской области

врач-вирусолог вирусологической лаб. Нижний Новгород

Надежда Александровна КАЛАШНИКОВА

Центр гигиены и эпидемиологии в Нижегородской области

Email: kornnvir@mail.ru
зав. вирусологической лаб. Нижний Новгород

Надежда Алексеевна НОВИКОВА

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора

Email: mevirfc@rambler.ru
д-р биол. наук, проф., руководитель лаб. молекулярной эпидемиологии вирусных инфекций Нижний Новгород

Список литературы

  1. Лукашев А.Н., Резник В.И., Иванова О.Е. и др. Mолекулярная эпидемиология вируса ЕCНО 6 - возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. Вопр. вирусол. 2008; 1: 16-21.
  2. Онищенко Г.Г., Новикова Н.А., Ефимов Е.И. и др. Cезон энтеровирусного серозного менингита в Н. Новгороде в 2007 году: молекулярно-эпидемиологические аспекты. Журн. микробиол. 2009; 2: 24-30.
  3. Antona D., Leveque N., Chomel J.J. et al. Surveillance of enterovirus in France, 2000—2004. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2007; 26: 403—412.
  4. Khetsuriani N., LaMonte-Fowlkes A., Oberste M.S. Pallansh M.A. Enterovirus surveillance United States, 1970—2005. MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 2006; 55: 1—20.
  5. Momoki T.S. Surveillance of enterovirus infections in Yokohama city from 2004 to 2008. Jpn. J. Infect. Dis. 2009; 62: 471—473.
  6. Nonpolio Enterovirus and human Parechovirus Surveillance — Unated States, 2006—2008. MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 2010; 59: 1577—1580.
  7. Roth B., Enders M., Arents A. et al. Epidemiologic aspects and laboratory features of enterovirus infections in Western Germany, 2000—2005. J. Med. Virol. 2007; 79: 956—962.
  8. Trallero G., Avellon A., Otero A. et al. Enteroviruses in Spain over the decade 1998—2007: virological and epidemiological studies. J. Clin. Virol. 2010; 47: 170—176.
  9. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. J. Clin. Microbiol. 2006; 44: 2698—2704.
  10. Голицына Л.Н., Фомина С.Г., Новикова Н.А. и др. Молекулярно-генетические варианты вируса ЕСНО 9, идентифицированние у больных серозным менингитом в России в 2007—2009 гг. Вопр. вирусол. 2011; 6: 37—42.
  11. Новикова Н.А., Голицина Л.Н., Фомина С.Г., Ефимов Е.И. Молекулярний мониторинг неполиомиелитных энтеровирусов на территории России в 2008—2011 г. Журн. микробиол. 2013; 1: 75—78.
  12. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28: 2731—2739.
  13. Bailly J.L., Mirand A., Henquell C. et al. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene. Infect. Genet. Evol. 2009; 9: 699—708.
  14. Blomqist S., Paananen A, Salovainen-Kopra C. et al. Eight years of experience with molecular identification of human enteroviruses. J. Clin. Microbiol. 2008; 46: 2410—2413.
  15. Mirand A., Hequell C., Archimbaud C. et al. Prospective identification of enteroviruses involved in meningitis in 2006 through direct genotyping in cerebrospinal fluid. J. Clin. Microbiol. 2008, 46: 87—96.
  16. Fares W., Rezig D., Seghier M. et al. Phylogenetic analysis of complete VP1 sequences of echoviruses 11 and 6: high genetic diversity and circulation of genotypes with a wide geographical and temporal range. J. Med. Microbiol. 2011; 60: 1017—1025.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО «Бионика Медиа», 2013

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах