ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ BRUCELLA MELITENSIS НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ВАРИАБЕЛЬНОСТИ INDEL-ЛОКУСОВ
- Авторы: КОВАЛЕВ Д.А.1, КУЗНЕЦОВА И.В.1, ЖИРОВ А.М.1, СЕРДЮК Н.С.1, ЖИЛЧЕНКО Е.Б.1, ПОНОМАРЕНКО Д.Г.1, ВОДОПЬЯНОВ А.С.2, ВОДОПЬЯНОВ С.О.2, КУЛИЧЕНКО А.Н.1
-
Учреждения:
- Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
- Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
- Выпуск: Том 12, № 1 (2022)
- Страницы: 81-86
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.eco-vector.com/2226-6976/article/view/287886
- DOI: https://doi.org/10.18565/epidem.2022.12.1.81-6
- ID: 287886
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
Дмитрий Анатольевич КОВАЛЕВ
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: kovalev_da.stv@list.ru
к.х.н., заведующий лабораторией биохимии Ставрополь, Россия
Ирина Владимировна КУЗНЕЦОВА
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
врач-бактериолог лаборатории биохимии Ставрополь, Россия
Андрей Михайлович ЖИРОВ
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
научный сотрудник лаборатории биохимии Ставрополь, Россия
Наталья Сергеевна СЕРДЮК
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
к.б.н., биолог лаборатории «Коллекция патогенных микроорганизмов» Ставрополь, Россия
Елена Борисовна ЖИЛЧЕНКО
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
к.б.н., заведующая лабораторией «Коллекция патогенных микроорганизмов» Ставрополь, Россия
Дмитрий Григорьевич ПОНОМАРЕНКО
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
к.б.н., заведующий лабораторией бруцеллеза Ставрополь, Россия
Алексей Сергеевич ВОДОПЬЯНОВ
Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Email: alexvod@gmail.com
к.м.н., руководитель группы вирусологии Ростов-на-Дону, Россия
Сергей Олегович ВОДОПЬЯНОВ
Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Email: serge100v@gmail.com
д.м.н., заведующий лабораторией биохимии микробов Ростов-на-Дону, Россия
Александр Николаевич КУЛИЧЕНКО
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора
Email: stavnipchi@mail.ru
член-корр. РАН, директор Ставрополь, Россия
Список литературы
- Orzil L., Preis I.S., Almeida I.G., Souza P.G., Soares Filho P.M., Jacinto F.B. et al. Validation of the multiplex PCR for identification of Brucella spp. Ciência Rural. 2016; 46(5): 847-52. doi: https://doi.org/10.1590/0103-8478cr20150065
- Малышев Д.В., Баннов В.А., Черных О.Ю., Василевич Ф.И., Котельникова А.А., Донник И.М. и др. Правообладатель ФГБОУ ВО «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина». Способ выявления генома возбудителя бруцеллезной инфекции (Brucella spp.) у сельскохозяйственных животных. Патент РФ № 2703400, 2019.
- Sankarasubramanian J., Vishnu U.S., Gunasekaran P., Rajendhran J. A genome-wide SNP-based phylogenetic analysis distinguishes different biovars of Brucella suis. Infect. Genet. Evol. 2016; 41: 213-7. doi: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2016.04.012
- Vergnaud G., Hauck Y., Christiany D., Daoud B., Pourcel C., Jacques I. et al. Genotypic Expansion Within the Population Structure of Classical Brucella Species Revealed by MLVA16 Typing of 1404 Brucella Isolates From Different Animal and Geographic Origins, 1974-2006. Front Microbiol. 2018; 9 (8): 1253-62. doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01545
- Lee H., Nguyen M.P., Choi Y., Kim Y.-H. Minimum InDel pattern analysis of the Zika virus. BMC Genomics 2018; 19(1): 535. doi: https://doi.org/10.1186/s12864-018-4935-z
- R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/
- Wickham H., Averick M., Bryan J., Chang W., McGowan L., François R. et al. Welcome to the Tidyverse. J. Open. Source Softw. 2019; 4(43): 1686. doi: https://doi.org/10.21105/joss.01686
- R package version 1.0.12. https://CRAN.R-project.org/package=pheatmap
- Pisarenko S.V., Kovalev D.A, Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V. et al. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics 2018; 19(1): 353. doi: https://doi.org/10.1186/s12864-018-4762-2
- Liu Z., Wang C., Wei K., Zhao Z., Wang M., Li D. et al. Investigation of Genetic Relatedness of Brucella Strains in Countries Along the Silk Road. Frontiers in veterinary science 2021; 7: 539444. https://doi.org/10.3389/fvets.2020.539444
- Ковалев Д.А., Кузнецова И.В., Сирица Ю.В., Ульшина Д.В., Шапаков Н.А., Бобрышева О.В. и др. авторы. Правообладатель ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Способ генетического INDEL-типирования штаммов Brucella melitensis. Патент РФ № 2732425, 2020.
Дополнительные файлы
