Генетическая гетерогенность штаммов Streptococcus pyogenes генотипа етт12



Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Проведено комплексное генетическое исследование штаммов Streptococcus pyogenes генотипа етт12, выделенных от детей в Санкт-Петербурге в течение 2007 г. Проанализированы SmaI рестрикционные паттерны геномной ДНК исследуемых штаммов. Изучена распространенность фаговых генов (генов, кодирующих факторы патогенности, а также генов фаговых интеграз). Обнаружена значительная генетическая гетерогенность изученных штаммов. Выявлен ген транспозона, ранее не обнаруженный у штаммов S. pyogenes.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Екатерина Михайловна Полякова

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

Email: katerinapolyakova@rambler.ru

Е С Мнацаканян

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

Л А Бурова

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

А В Дмитриев

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН»

Список литературы

  1. Полякова Е.М., Гао В., Янг Я. и др. Молекулярногенетическое сравнение штаммов Streptococcus pyogenes типов еттl и еттl 2 по набору профаговых генов // Журн. микробиол. 2009. Т. 2. С. 18-24.
  2. Banks D.J., Lei В. & Musser J.M. Prophage induction and expression of prophage-encoded virulence factors in group A streptococcus serotype М3 strain MGAS315 // Infect. Imirnin. 2003. Vol. 71. № 12. P. 7079-7086.
  3. Beres S.B., Sylva G.L., Barbian K.D. et al. Genome sequence of a serotype М3 strain of group A Streptococcus: phage-encoded toxins, the high-virulence phenotype, and clone emergence // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. № 15. P. 10078-10083.
  4. Beres S.B., Musser J.M. Contribution of Exogenous Genetic Elements to the Group A Streptococcus Metagenome // PLoS ONE 2: e800.
  5. Carapetis J., Robins-Browne R., Martin D. et al. Increasing severity of invasive group A streptococcal disease in Australia: clinical and molecular epidemiological features and identification of a new virulent M- non-typeable clone // Clin. Infect. Dis. Vol. 21. № 5. P. 1220-1227.
  6. Cunningham M.W. Pathogenesis of Group A Streptococcal diseases // Clin. Microbiol. Rev. 2000. Vol. 13. №3. P.470-511.
  7. Dopazo J., Mendoza A., Herrera.1. et al. Annotated draft genomic sequence from a Streptococcus pneumoniae type 19F clinical isolate // Microbiol. Drug. Resist. 2001. Vol. 7. № 2. P. 99-125.
  8. Ekelund K., Skinhoj P., Madsen J. et al. Reemergence of emm and a changed superantigen profile for group a streptococci causing invasive infections: results from a nationwide study // J. Clin. Microbiol. 2005. Vol. 43. №4. P. 1789-1796.
  9. Elliot J.A., Farmer K.D., Facklam R.R. Sudden increase in isolation of group В streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new pulsed-fteld gel electrophoresis type // J. Clin. Microbiol. 1998. Vol. 36. P.2115-2116.
  10. Facklam R.F., Martin D.R., Lovgren M. et al. Extension of the Lancefield classification for group A streptococci by addition of 22 new M protein gene sequence types from clinical isolates: emml03 to emml24 // Clin. Infect. Dis. 2002. Vol. 34. № 1. P. 28-38.
  11. Ferretti J.J., McShan W.M., Ajdic D. et al. Complete genome sequence of an M1 strain of Streptococcus pyogenes 11 Proceeding of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2001. Vol. 98. № 8. P. 4658-4663.
  12. Green N.M., Beres S.B., Graviss E.A. et al. Genetic diversity among type emm28 group A Streptococcus strains causing invasive infections and pharyngitis // J. Clin. Microbiol. 2005. Vol. 43. № 8. P. 4083-4091.
  13. Holden M.T., Scott A., Cherevach I. et al. Complete genome of acute rheumatic fever-associated serotype M5 Streptococcus pyogenes strain manfredo 11 J. Bacterid. 2007. Vol. 189. № 4. P. 1473-1477.
  14. Holm S.E., Norrby A., Bergholm A.M. et al. Aspects of pathogenesis of serious group A streptococcal infections in Sweden 1988-1989//.1. Infect. Dis. 1992. Vol. 166. № 1. P.31-37.
  15. Ho P.L., Johnson D.R., Yue A.W.Y. et al. Epidemiologic analysis of invasive and noninvasive group A streptococcal isolates in Hong Kong // J. Clin. Microbiol. 2003. Vol. 41. № 3. P. 937-942.
  16. Jing H., Ning В., Hao H. et al. Epidemiological analysis of group A streptococci recovered from patients in China // Med. Microbiol. 2006. Vol. 55. № 8. P. 1101-1107.
  17. Kaul R.A., McGeer A., Low D.E. et al. Population- based surveillance for group A Streptococcal necrotizing fasciitis, clinical features, prognostic indicators, and microbiologic analysis of seventy-seven cases // Am. J. Med. 1997. Vol. 103. № 1. P. 18-24.
  18. Kiska D.L., Thiede B., Caracciolo J. et al. Invasive group A streptococcal infections in North Carolina: epidemiology, clinical features, and genetic and serotype analysis of causative organisms // J. Infect. Dis. 1997. Vol. 176. №4. P.992-1000.
  19. Matthews R.C. PCR fingerprinting microbes by random amplification of polymoiphic DNA // J. Med. Microbiol. 1993. Vol. 39. № 3. P. 161-162.
  20. Musser J.M. and Krause R.M. The revival of group A streptococcal diseases, with a commentary on staphylococcal toxic shock syndrome // Emerging Infections. 1998. P. 185-218.
  21. Nandi S., Ganguly N., Kumar R. et al. Genotyping of group A streptococcus by various molecular methods // Indian J. Med. Res. 2008. Vol. 127. № 1. P. 71-77.
  22. O’Brien K.L. et al. Epidemiology of invasive Group A Streptococcus disease in the United States, 1995-1999 I I Clin. Infect. Dis. 2002. Vol. 35. № 11. P. 268-276.
  23. Rogers S., Commons R., Danchin M. et al. Strain prevalence, rather than innate virulence potential, is the major factor responsible for an increase in serious group A streptococcus infections // J. Infect. Dis. 2007. Vol. 195. № 11. P. 1625-1633.
  24. Seppala H., He Q., Osterblad M. et al. Typing of group A streptococci by random amplified polymorphic DNA analysis // J. Clin. Microbiol. 1994. Vol. 32. № 8. P. 1945-1948.
  25. Sharkawy A. et al. Severe group A streptococcal soft tissue infections in Ontario: 1992-1996 // Clin. Infect. Dis. 2002. Vol. 34. № 4. P. 454-460.
  26. Smoot J.C., Barbian K.D., Van Gompel J.J. et al. Genome sequence and comparative microarray analysis of serotype Ml8 group A Streptococcus strains associated with acute rheumatic fever outbreaks // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. № 7. P. 4668-4673.
  27. Suvorov A., Polyakova E., McShan W. & Ferretti J. Bacteriophage content of M49 strains of Streptococcus pyogenes // FEMS microbiology letters. In press.
  28. Vlaminckx B.J., Schuren F.H., Montijn R.C. et al. Determination of the relationship between group A streptococcal genome content, M type, and toxic shock syndrome by a mixed genome microarray // Infect. Immunol. 2007. Vol. 75. № 5. P. 2603-2611.
  29. Wahl R.U., Ltitticken R., Stanzel S. et al. Epidemiology of invasive Streptococcus pyogenes infections in Germany, 1996-2002: results from a voluntary laboratory surveillance system // Clin. Microbiol. Infect. 2007. Vol. 13. № 12. P. 1173-1178.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Полякова Е.М., Мнацаканян Е.С., Бурова Л.А., Дмитриев А.В., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах