ПРОЦЕССЫ РНК-ИНТЕРФЕРЕНЦИИ КАК МЕХАНИЗМ РЕГУЛЯЦИИ АКТИВНОСТИ ГЕНОВ В НЕРВНОЙ И ИММУННОЙ СИСТЕМАХ



Цитировать

Полный текст

Аннотация

Обзор посвящен анализу результатов исследования процессов РНК-интерференции в нервной и иммунной системах, структуре и функциям малых РНК, возможностям использования сиРНК и микроРНК в терапии заболеваний человека, а также ряду проблем, связанных с анализом особенностей функционирования системы сиРНК у разных организмов, природы сигналов для появления днРНК, технологических подходов к скринингу мишений для РНК-интерференции.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Т Б КАЗАКОВА

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН», Санкт-Петербург

Санкт-Петербург, 197376, ул. Академика Павлова, 12

Е А КОРНЕВА

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН», Санкт-Петербург

академик РАМН Санкт-Петербург, 197376, ул. Академика Павлова, 12

Список литературы

  1. Авилов С. РНК-интерференция против «неправильных» генов // «Вокруг Света»: Генетический форум «Как заставить молчать гены? РНК-интерференция». 2007. 3 с. http://geneforum.ru/login.php
  2. Вильгельм А.Э., Чумаков СП., Прасолов B.C. Интерференция РНК: биология и перспективы применения в биомедицине и биотехнологии // Мол. биол. 2006. Т. 40. С. 387-403.
  3. Григорович С. GenoTerra: Информационно-аналитическое издание о генетике. 2007. http://ge-noterra.ru/news/view/18/776
  4. Клёнов М.С. Лауреаты Нобелевской премии 2006 года по физиологии и медицине / Э. Файер и К. Мэллоу // Природа. 2007. № 1. С. 76-79.
  5. Appasani К. Global enthusiasm for RNA interference // Curr. Drug. Discovery. 2004. P. 32-34.
  6. Bantounas I., Phylactou L.A., Uney J.B. RNA interference and the use of small interfering RNA to study gene function in mammalian systems // J. Mol. Endocrinol. 2004. Vol. 33. P. 545-557.
  7. Bentwich I., Avniel A., Karov Y. et al. Identification of hundreds of conserved and noncon nonconserved human microRNAs // Nat. Genet. 2005. Vol. 37. P. 766-770.
  8. Bentwich I. Prediction and validation of microRNAs and their targets // FEBS Lett. 2005. Vol. 579. P. 5904-5910.
  9. Bernstein E., Caudy A., Hammond S., Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference // Nature. 2001. Vol. 409. P. 363-366.
  10. Brennecke J., Hipfner D.R., Stark A. et al. Bantam encodes a developmentally regulated microRNA that controls cell proliferation and regulates the proapop-totic gene hid in Drosophila // Cell. 2003. Vol. 113. P. 25-36.
  11. Carthew R.W. A new RNA dimension to genome control // Science. 2006. Vol. 313. P. 305-306.
  12. Chan J.A., Krichevsky A.M., Kosik K.S. MicroRNA-21 is an antiapoptotic factor in human glioblastoma cells // Cancer Res. 2005. Vol. 65. P. 6029-6033.
  13. Cheng H.-Y.M., Papp J.W., Varlamova O. et al. MicroRNA modulation of circadian-clock period and entrainment//Neuron. 2007. Vol. 54. P. 813-829.
  14. Cheng L.C., Tavazoie M., Doetsch F. Stem cells: from epigenetics to microRNAs // Neuron. 2005. Vol. 46. P. 363-367.
  15. Couzin J. Erasing microRNAs reveals their powerful punch // Science. 2007. Vol. 316. P. 30.
  16. Daneholt B. The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2006, Advanced Information // Nobelforsam-lingen, The Nobel Assably at Karolinska Institutet. 2006.
  17. DeChiara T.M., Brosius J. Neural BC1 RNA: cDNA clones reveal nonrepetitive sequence content // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1987. Vol. 8. P. 2624-2628.
  18. Diederichs S., Haber D.A. Dual role for argonautes in microRNA processing and posttranscriptional regulation of microRNA expression // Cell. 2007. Vol. 131. P. 1097-1108.
  19. Dillon Ch.R, Sandy P., Nencioni A. et al. RNAi as an experimental and therapeutic tool to study and regulate physiological and disease processes // Ann. Rev. Physio. 2005. Vol. 67. P. 147-173.
  20. Doench J.G., Petersen Ch.R, Sharp PA. siRNAs can function as miRNAs // Genes. Dev. 2003. Vol. 17. P. 438-442.
  21. Doench J.G., Sharp PA. Specificity of microRNA target selection in translational repression // Genes Dev. 2004. Vol. 18. P. 504-511.
  22. Eulalio A., Huntzinger E., Izaurralde E. Getting to the root of miRNA-mediated gene silencing // Cell. 2008. Vol. 132. P. 9-14.
  23. Fire A., Xu S., Montgomery M.K., Kostas S.A. et al. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans // Nature. 1998. Vol. 391. P. 806-811.
  24. Fire A. RNA-triggered gene silencing // TIG. 1999. Vol. 15. P. 358-363.
  25. Giese K. siRNA as a route to new cancer therapies // Curr. Drug. Discovery. 2004. P. 25-28.
  26. Gregory R.I., Shiekhattar R. MicroRNA biogenesis and cancer // Cancer Res. 2005. Vol. 65. P. 3509-3512.
  27. Grophans H., Fillipowicz W. The expanding world of small RNAs //Nature. 2008. Vol. 451. P. 414-416.
  28. Gran D., Wang Y.L., Langenberger D., Gunsalus K.C., Rajewsky N. microRNA target predictions across seven Drosophila species and comparison to mammalian targets //PLoS Comput. Biol. 2005. P. I:el3.
  29. Hammond S., Bernstein E., Beach D., Hannon G. An RNA-directed nuclease mediates post-transcription-al gene silencing in Drosophila cells // Nature. 2000. Vol. 404. P. 293-296.
  30. Flobert O. Common logic of transcription factor and microRNA action // Trends Biochem. Sci. 2004. Vol. 29. P. 462-468.
  31. Huttenhofer A., Kiefmann M., Meier-Ewert S. et al. RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse //'EMBO J. 2001. Vol. 20. P. 2943-2953.
  32. Hutvagner G., McLachlan J., Pasquinelli A.E. et al. A cellular function for the RNA-interference enzyme Dicer in the maturation of the let-7 small temporal RNA // Science. 2001. Vol. 293. P. 834-838.
  33. Iorns E., Lord C.H.J., Turner N, Ashworth A. Utilizing RNA interference to enhance cancer drug discovery // Nature. 2007. Vol. 6. P. 556-568.
  34. Johnston R.J., Hobert O.A microRNA controlling left/ right neuronal asymmetry in Caenorhabditis elegans // Nature. 2003. Vol. 426. P. 845-849.
  35. Kalluri R., Kanasaki K. Generic block an angiogenesis //Nature. 2008. Vol. 452. P. 543-545.
  36. Kim J., Krichevsky A., Grad Y. et al. Identification of many microRNAs that copurify with polyribosomes in mammalian neurons // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2004. Vol. 101. P. 360-365.
  37. Kim D.H., Rossi J. RNAi mechanisms and applicatios // BioTechniques. 2008. Vol. 44. P. 613-616.
  38. Kitabwalla M., Ruprecht R.M. Clinical implications of basic research // N. Eng. J. Med. 2002. Vol. 347. P. 1364-1367.
  39. Kleinman M.E., Yamada K., Takeda A. et al. Sequence- and target-independent angiogenesis suppression by siRNA via TLR3 // Nature. 2008. Vol. 452. P. 591-597.
  40. Kloosterman W.P., Wienholds E., Ketting R.F., Plasterk R.H. Substrate requirements for let-7 function in the developing zebrafish embryo // Nucleic. Acids. Res. 2005. Vol. 32. P. 6284-6291.
  41. Kosik K.S. The neuronal microRNA system // Nature Rev. Neuroscience. 2006. Vol. 7. P. 911-920.
  42. Kosik K.S., Krichevsky A.M. The Elegance of the MicroRNAs: A Neuronal Perspective // Neuron. 2005. Vol. 47. P. 779-782.
  43. Lau N.C., Seto A.G., Kim J. et al. Characterization of the piRNA complex from rat testes // Science. 2006. Vol. 313. P. 363-372.
  44. Lee Y, Ahn C, Han J. et al. The nuclear RNase III Drosha initiates microRNA processing // Nature. 2003. Vol. 425. P. 415-419.
  45. Lewis B.P, Shih I.H., Jones-Rhoades M.W et al. Prediction of mammalian microRNA targets // Cell. 2003. Vol. 115. P. 787-798.
  46. Lim L.P., Lau N.C., Garrett-Engele P. et al. Microarray analysis shows that some microRNAs downregu-late large numbers of target mRNAs // Nature. 2005. Vol. 433. P. 769-773.
  47. Lukiw W.J., Handley P., Wong L. et al. BC200 RNA in normal human neocortex, non-Alzheimer dementia (NAD), and senile dementia of the Alzheimer type (AD) //Neurochem. Res. 1992. Vol. 7. P. 591-597.
  48. Мао C.P., Hung C.F., Wu T.C. Immunotherapeutic strategies employing RNA interference technology for the control of cancers // J. Biomed. Sci. 2007. Vol. 14. P. 15-29.
  49. Martinez J., Patkaniowska A., Urlaub H et al. Singlestranded antisense siRNAs guide target RNA cleavage in RNAi // Cell. 2002. Vol. 110. P. 563-574.
  50. Meguro M., Mitsuya K., Nomura N. et al. Largescale evaluation of imprinting status in the Prader-Willi syndrome region: an imprinted direct repeat cluster resembling small nucleolar RNA genes // Hum. Mol. Genet. 2001. Vol. 10. P. 383-394.
  51. Mi Sh., Cai Т., Hu Y. et al. Sorting of small RNAs into Arabidopsis Argonaute complex is directed by the 5'-terminal nucleotide // Cell. 2008. Vol. 133. P. 116-127.
  52. Plasterk, RHA., RNA Silencing: The Genome's Immune System // Science. 2002. Vol. 296. P. 1263-1265.
  53. Presutti. C, Rosati J., Vincenti S., Nasi S. Non coding RNA and Brain // Neurosci. 2006. Vol. 7 (Suppl. 1). S5.
  54. Rodriguez A., Vigorito E., Clare S. et al. A Requirement of bic/microRNA-155 for normal immune function // Science. 2007. Vol. 316. P. 608-611.
  55. Rusinov V, Baev V, Minkov I.N., Tabler M. MicroInspector: a web tool for detection of miRNA binding sites in an RNA sequence // Nucleic Acids Res. 2005. Vol. 33 (Suppl. 2). P. W696-W700.
  56. Sempere L.F., Freemantle S., Pitha-Rowe I. et al. Expression profiling of mammalian microRNAs uncovers a subset of brain-expressed microRNAs with possible roles in murine and human neuronal differentiation // Genome Biol. 2004. Vol. 5. P. R13.
  57. Sharp PA. The Biology of Short RNAs // In «RNA World», Cold Spring Harbor Lab. Press, Cold Spring Harbor. NY, 2006.
  58. Stefani G., Slack F.J. Small non-coding RNAs in animal development//Nature Rev. Mol. Cell. Biol. 2008. Vol. 9(3). P. 219-230.
  59. Tiedge H., Chen W., Brosius J. Primary structure, neuralspecific expression, and dendritic location of human BC200 RNA// J. Neurosci. 1993. Vol. 13. P. 23822390.
  60. Tiedge H, Fremeau R.T.Jr., Weinstock PH. et al. Dendritic location of neural BC1 RNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. Vol. 88. P. 2093-2097.
  61. Tili E., Michaille J.-J., Cimino A. et al. Modulation of miR-155 and miR-125b levels following lipopolysaccharide/TNF-a stimulation and their possible roles in regulating the response to endotoxin shock // J. Immunol. 2007. Vol. 179. P. 5082-5089.
  62. Tuschl T. Expanding small RNA interference // Nat. Biotechnol. 2002. Vol. 20. P. 446-448.
  63. van Rooij E., Olson E.N. MicroRNAs: powerful new regulators of heart disease and provocative therapeutic targets // J. Clin. Invest. 2007. Vol. 4. P. 2369-2376.
  64. Vasudevan S., Tong Y, Steitz J.A. Switching from repression to activation: microRNAs can up-regulate translation // Science. 2007. Vol. 318. P. 1931-1934.
  65. Vella M.C., Reinert K., Slack F.J. Architecture of a validated microRNA: target interaction // Chem. Biol. 2004. Vol. 11. P. 1619-1623.
  66. Vo N, Klein M.E., Variamova O., Keller D.M. et al. cAMP-response element binding protein-induced microRNA regulates neuronal morphogenesis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. Vol. 102. P. 1642616431/
  67. Yi R., QinY, Macara I.G., Cullen B.R. Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs // Genes Dev. 2003. Vol. 17. P. 3011- 3016.
  68. Yi R., Poy M.N., Stoffel M., Fuchs E. A skin microRNA promotes differentiation by repressing «stemness» // Nature. 2008. Vol. 452. P. 225-229.
  69. Zalfa F, Giorgi M., Primerano B. et al. The fragile x syndrome protein FMRP associates with ВС 1 RNA and regulates the translation of specific mRNAs at synapses//Cell. 2003. Vol. 112. P. 317-327.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© КАЗАКОВА Т.Б., КОРНЕВА Е.А., 2009

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах