Increase of efficiency of QSAR — the analysis of carcinogenic activity of halogeneted hydrocarbons



Cite item

Full Text

Abstract

The new principle of analysis of structureactivity of carcinogenic compounds is offered. It is basis on use a compound structural descriptors representing a combination untied among themselves of structural fragments of a molecule. The computer program is developed, allowing to generate every possible structural fragments of molecules of chemical compounds and their  combinations and to carry out selection of the compound descriptors statistically significantly influencing their biological activity. In work it is used the samples consisting of 89 halogeneted hydrocarbons for which their carcinogenic activity on rodents is investigated.

About the authors

Aleksey V Tarasov

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Serikbay K Abilev

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Email: serikbai@mail.ru

Ramis M Velibekov

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Valentin A Tarasov

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Email: vat.vigg@mail.ru

References

  1. Худолей В.В. Канцерогены: характеристики, закономерности, механизмы действия. -СПб.: НИИ Химии СПбГУ, 1999. -419 с.
  2. Cunningham A.R., Klopman G., Rosenkranz H.S. Iden ti fi cation of structural features and associated mechanisms of action for car cinogens in rats//Mutation Res. -1998. -Vol. 405. -P. 9-28.
  3. Rosenkranz H.S., Cunningham A.R., Klopman G. Identi fi cation of 2D geometric descriptor associated with nongenotoxic car ci nogens and estrogens and antiestrogens//Mutagenesis. -1996. -Vol. 11. -P. 95-100.
  4. Харчевникова Н.В., Жолдакова З.И., Журков В.С. Теоретическое обоснование связи структура-генотоксичность для млекопитающих и бактерий в ряду галогензамещенных алифатических соединений с короткой цепью//Вестн. РАМН. -1997. -№ 12. -С. 8-13.
  5. Hansch C., Leo A. QSAR. Part I. Fundamentals and applications in chemistry and biology//American. Chem. Soc. -Washington, D, 1995.
  6. Fujita T. Recent success stories leading to commercializable bio active compounds with the aid of traditional QSAR procedures//QSAR. -1997. -Vol. 16. -P. 107-112.
  7. Benigni R. The first US National Toxicology Program com pa ra tive exercise on the prediction of rodent carcinogenicity: de fi ni ti ve results//Mutation Res. -1997. -Vol. 387. -P. 35-45.
  8. Benigni R., Zito R. The second National Toxicology Program com parative exercise on the prediction of rodent car ci no ge ni ci ty: definitive results//Mutation Res. -2004. -Vol. 566. -P. 49-63.
  9. Тарасов В.А., Асланян М.М., Абилев С.К. Принципы формализованной количественной оценки опасности химических соединений для человека//Генетика. -1999. -Т. 35. -С. 1585-1599.
  10. Тарасов В.А., Тарасов А.В., Любимова И.К., Асланян М.М. Проблема количественной оценки опасности химических соединений в генетической токсикологии//Усп. совр. биол. -2002.-Т. 122, № 2. -С. 136-147.
  11. Баскин И.И., Палюлин В.А. Зефиров Н.С. Применение искусственных нейронных сетей в химических и биохимических исследованиях//Вестн. Моск. ун-та. Сер. 2: Химия. -1999. -Т. 40, № 5. -С. 323-326.
  12. Баскин И.И., Гальберштам Н.М., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. NASAWIN -программный комплекс для изучения соотношения структура-свойство в химии//Тр. VII Всерос. конф. «Нейрокомпьютеры и их применение» с Международным участием. -М., 2001. -С. 419-422.
  13. Klopman G., Frierson M., Rosenkranz H. The structural basis of the mutagenicity of chemicals in Salmonella typhimurium: The Gene-Tox Data Base//Mutation Res. -1990. -Vol. 128. -P 1-50.
  14. Klopman G., Rozenkranz H.S. Approaches to SAR in car ci no ge nesis and mutagenesis. Prediction of carcinogenicity/mutagenicity using MULTICASE//Mutation Res. -1994. -Vol. 305. -P. 33-46.
  15. Benigni R., Passerini L. Carcinogenicity of the aromatic amines: from the structure-activity relationships to mechanisms of ac tion and risk assessment//Mutation Res. -2002. -Vol. 511. -P. 191-203.
  16. Tuppurainen K., Lotjonen S., Laatikainen R., Vartiainen T., Maran U., Strandberg M., Tamm T. About the mutagenicity of chlorine-substituted furanones and halopropenales. A QSAR study using molecular orbital indices//Mutation Res. -1991. -Vol. 247. -P. 97-102

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2005 Tarasov A.V., Abilev S.K., Velibekov R.M., Tarasov V.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 65617 от 04.05.2016.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies