GENETIC DIFFERENTIATION OF SPRUCE POPULATIONS IN NORTHWEST RUSSIA REVEALED WITH MICROSATELLITE MARKERS



Cite item

Full Text

Abstract

Analysis of genetic diversity of spruce populations in northwest Russia using microsatellite markers revealed two moderately distinctive genetic clusters. One of them combined trees that were determined by morphological featuers as P. abies. The other cluster included trees identified as P. obovata and P. fennica. The SSR analysis does not support taxonomical independence of the hybrid-derived species P. fennica. Occurrence of P. abies genotypes revealed by SSR analysis significantly decreases from the south to the north.

About the authors

Elena K Potokina

N. I. Vavilov Institute of Plant Industry, Saint-Petersburg, RF

Email: e.potokina@yahoo.com; e.potokina@vir.nw.ru

Larisa V Orlova

V. L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, RF

Email: orlarix@mail.ru

Maria S Vishnevskaya

N. I. Vavilov Institute of Plant Industry, Saint-Petersburg, RF

Email: pln@cnshb.ru

Ekaterina A Alekseeva

N. I. Vavilov Institute of Plant Industry, Saint-Petersburg, RF

Email: pln@cnshb.ru

Alexander F Potokin

Saint Petersburg State Forest Technical University, St. Petersburg, RF

Email: alex221957@mail.ru

Alexander A Egorov

Kirov State Forest Technical University , Saint-Petersburg, RF

Email: egorovfta@yandex.ru

References

  1. Бобров Е. Г. 1944. Об особенностях флоры эрратической области (Один из путей формообразования)//Сов. ботаника. № 2. С. 3-20.
  2. Комаров В. Л. 1934. Coniferales -хвойные//Флора СССР. Т. 1. С. 130-195.
  3. Нешатаев Ю. Н. 1987. Методы анализа геоботанических материалов. Ленинград: Изд-во Ленингр. ун-та, 192 с.
  4. Нешатаев В. Ю. 1989. Проект Всесоюзного кодекса фитоценологической номенклатуры. Л.: ВБО, 22 с.
  5. Орлова Л. В., Егоров А. А. К систематике и гео графическому распространению ели финской (Picea fennica (Regel) Kom., Pinaceae)//Новости систематики высших растений. М.СПб., 2011. Т. 42. С. 5-23.
  6. Политов Д. В. Генетика популяций и эволюционные взаимоотношения видов сосновых Северной Евразии: Автореф. дис. …докт. биол. наук. М., 47 с.
  7. Попов П. П. 1996. Гибридная ель на северо-востоке Европы//Лесоведение. № 2. С. 62-72.
  8. Попов П. П. 2000. Оценка влияния интрогрессивной гибридизации елей европейской и сибирской на структуру популяций//Проблемы взаимодействия человека и природной среды. Материалы итоговой науч. сессии Ученого совета Ин-та проблем освоения Севера СО РАН. Вып. 1. Тюмень.
  9. Попов П. П. 2010. Формовая структура и географическая дифференциация популяций ели на северо-западе России//Экология. № 5. С. 336-343.
  10. Раменский Л. Г., Ц аценкин И. А., Ч ижиков О. Н., Антипин Н. А. 1956. Экологическая оценка кормовых угодий по растительному покрову. М.: Государственное издательство сельскохозяйственной литературы, 472 с.
  11. Сукачев В. Н. 1912. Растительность верхней части бассейна реки Тунгира Олекминского округа Якутской области//Труды Амурской экспедиции. Вып. 16. 286 с.
  12. Сукачев В. Н. 1934. Дендрология с основами лесной геоботаники. Ленинград: Гослестехиздат. 614 с.
  13. Шенников А. П. 1938. Луговая растительность СССР//Растительность СССР. Т. 1. М.; Л.: Изд-во АН СССР, С. 429-647. 14. Acheré V., Faivre-Rampant P., Jeandroz S. et al., 2004.
  14. A full saturated linkage map of Picea abies including AFLP, SSR, ESTP, 5S rDNA and morphological markers//Theor. Appl. Genet. V.108. P. 1602-1613.
  15. Bousquet J., Simon L., Lalonde M. 1990. DNA amplification from vegetative and sexual tissues of trees using polyemerase chain reaction//Can. J. For. Res. V. 20. P. 254-257.
  16. Evanno G., Regnaut S., Goudet J. 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study//Mol. Ecol. Vol. 14. P. 2611-2620.
  17. Farjon A. 2001. World checklist and bibliograhy of conifers. 2nd ed. Kew. 309 p.
  18. Krutovskii K. V., Bergmann F. 1995. Introgressive hybridisation and phylogenetic relationships between Norway, Picea abies (L.) Karst. and Siberian, P. obovata Ledeb., spruce species studied by isozyme loci//Heredity. V. 74. P. 464-480.
  19. Paglia G., Morgante M. 1998. PCR-based multiplex DNA fingerprinting techniques for the analysis of conifer genomes//Mol. Breed. V. 4. P. 173-177.
  20. Peakall R., Smouse P. E. 2006. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research//Molecular Ecology Notes. V. 6. P. 288-295.
  21. Pritchard J. K. 2000. Inference of population structure using multilocus genotype data//Genetics. V. 155. P. 945-959.
  22. Rungis D., Bérubé Y., Zhang J. et al., 2004. Robust simple sequence repeat markers for spruce (Picea spp.) from expressed sequence tags//Theor. Appl. Genet. V. 109 (6). P. 1283-1294.
  23. Schmidt-Vogt H. 1977. Die Fichte. Verlag Paul Parey. Hamburg, Germany.
  24. Scotti I., Magni F., Fink R. et al., 2000. Microsatellite repeats are not randomly distributed within Norway spruce (Picea abies K.) expressed sequences//Genome. V. 43. P. 41-46.
  25. Tollefsrud M. M., Kissling R., Gugerli F. et al., 2008. Genetic consequences of glacial survival and postglacial colonization in Norway spruce: combined analysis of mitochondrial DNA and fossil pollen//Mol. Ecol. V.17 (18). P. 4134-4150.
  26. Tollefsrud M. M., Sønstebø J. H., Brochmann C. et al., 2009. Combined analysis of nuclear and mitochondrial markers provide new insight into the genetic structure of North European Picea abies//Heredity. V. 102 (6). P. 549-562.
  27. Wahlund S. 1928. Zusammensetzung von Populationen und Korrelationserscheinungen von Standpunkt der Vererbungslehre aus Betrachet//Hereditas. V. 11. P. 65-106.
  28. Wright S. 1951. The genetical structure of populations//Annual Eugenics. V. 15. P. 323-354.
  29. Wright S. 1978. Variability within and among natural populations//Evolution and the Genetics of Populations. The University of Chicago Press, Chicago. V. 4.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2012 Potokina E.K., Orlova L.V., Vishnevskaya M.S., Alekseeva E.A., Potokin A.F., Egorov A.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 65617 от 04.05.2016.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies