Белок NSP, кодируемый негативной цепью NS РНК вируса гриппа A, индуцирует клеточный иммунный ответ у инфицированных животных

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

При заражении мышей вирусами гриппа A наблюдали формирование клонов лимфоцитов, специфически распознающих вирусные домены в центральной зоне белка NSP (позиции аминокислот 83-119). Компьютерный анализ первичной структуры белка NSP показал наличие T-клеточных эпитопов в центральной части молекулы NSP. Полученные данные свидетельствуют о наличии экспрессии вирусного гена NSP в организме инфицированных животных и верифицируют концепцию о биполярной стратегии (амбисенс-стратегия) генома вируса гриппа А.

Об авторах

О. П. Жирнов

Научно-исследовательский институт вирусологии им. Д.И. Ивановского Федерального научно-исследовательского центра эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации; Русско-немецкая академия медицинских и социальных наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: zhirnov@inbox.ru
Россия, 123098, город Москва, улица Гамалеи, 16; 121205, город Москва, улица Новый Арбат, 36-9

Е. И. Исаева

Научно-исследовательский институт вирусологии им. Д.И. Ивановского Федерального научно-исследовательского центра эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: zhirnov@inbox.ru
Россия, 123098, город Москва, улица Гамалеи, 16

Список литературы

  1. Dou D., Revol R., Östbye H., Wang H., Daniels R. Influenza A Virus Cell Entry, Replication, Virion Assembly and Movement // Front Immunol. 2018. V. 9. P. 1581. doi: 10.3389/fimmu.2018.01581
  2. Palese Baez M., Zazra J.J., Elliott R.M., Young J.F., Palese P. Nucleotide Sequence of the Influenza A/duck/Alberta/60/76 virus NS RNA: Conservation of the NS1/NS2 Overlapping Gene Structure in a Divergent Influenza Virus RNA Segment // Virology. 1981. V. 113. № 1. P. 397-402.
  3. Жирнов О.П., Поярков С.В., Воробьева И.В., Сафонова О.А., Малышев Н.А., Кленк Н.Д. Сегмент NS вирусов гриппа А содержит дополнительный ген NSP в позитивной ориентации // ДАН. 2007. Т. 414. № 4. С. 547-553. PubMed PMID: 17695319.
  4. Zhirnov O.P., Vorobjeva I.V., Saphonova O.A., Poyarkov S.V., Ovcharenko A.V., Anhlan D., Malyshev N.A. Structural and Evolutionary Characteristics of HA, NA, NS and M Genes of Clinical Influenza A/H3N2 Viruses Passaged in Human and Canine Cells // J. Clin. Virol. 2009. V. 45. № 4. P. 322-333. doi: 10.1016/j.jcv.2009.05.030
  5. Жирнов О.П., Акулич К.А., Липатова А.В., Усачев Е.В. Негативно-полярная вирионная РНК сегмента 8 (NS) вируса гриппа А способна транслировать in vitro новый вирусный белок // ДАН. 2017. Т. 473. № 4. С. 122-127. doi: 10.1134/S160767291 7020090
  6. Clifford M., Twigg J., Upton C. Evidence for a Novel Gene Associated with Human Influenza A viruses // Virol. J. 2009. V. 6. P. 198. DOI: 10.1186/ 1743-422X 6-198
  7. Gong Y.N., Chen G.W., Chen C.J., Kuo R.L., Shih S.R. Computational Analysis and Mapping of Novel Open Reading Frames in Influenza A Viruses // PLoS One. 2014. V. 9. № 12. e115016. doi: 10.1371/journal.pone.0115016
  8. Yang C.W., Chen M.F. Uncovering the Potential Pan Proteomes Encoded by Genomic Strand RNAs of Influenza A Viruses // PLoS One. 2016. V. 11. № 1. e0146936. doi: 10.1371/journal.pone. 0146936
  9. Sabath N., Morris J.S., Graur D. Is There a Twelfth Protein-Coding Gene in the Genome Of Influenza A? A Selection-Based Approach to the Detection of Overlapping Genes in Closely Related Sequences // J. Mol. Evol. 2011. V. 73. № 5/6. P. 305-315. doi: 10.1007/s00239-011-9477-9
  10. Jensen K.K., Andreatta M., Marcatili P., Buus S., Greenbaum J.A., Yan Z., Sette A., Peters B., Nielsen M. Improved Methods for predicting Peptide Binding Affinity to MHC Class II Molecules // Immunology. 2018. V. 154. № 3. P. 394-406. doi: 10.1111/imm.12889
  11. Bhasin M., Raghava G.P.S. A Hybrid Approach for Predicting Promiscuous MHC Class I restricted T Cell Epitopes // J. Biosci. 2006. V. 32. P. 31-42.
  12. Jameson B.A., Wolf H. The Antigenic Index: a Novel Algorithm for Predicting Antigenic Determinants // Comput. Appl. Biosci. 1988. V. 4. № 1. P. 181-186.
  13. Panthu B., Terrier O., Carron C., Traversier A., Corbin A., Balvay L., Lina B., Rosa-Calatrava M., Ohlmann T. The NS1 Protein from Influenza Virus Stimulates Translation Initiation by Enhancing Ribosome Recruitment to mRNAs // J. Mol. Biol. 2017. V. 429. № 21. P. 3334-3352. doi: 10.1016/j.jmb.2017.04.007
  14. Zhong W., Reche P.A., Lai C.C., Reinhold B., Reinherz E.L. Genome-Wide Characterization of a Viral Cytotoxic T Lymphocyte Epitope Repertoire // J. Biol. Chem. 2003. V. 278. № 46. P. 45 135-45 144.
  15. Nguyen M., Haenni A.L. Expression Strategies of Ambisense Viruses // Virus Res. 2003. V. 93. № 2. P. 141-150.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2019

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах