Полиморфизмы генов лейкоцитарного антигена человека и врожденного иммунитета, ассоциированные с разной степенью тяжести течения новой коронавирусной инфекции
- Авторы: Бутусов А.М.1, Круско О.В.1, Потапов П.К.1, Деревянкин Д.С.1, Заграничнов В.Д.1, Малышкин С.С.1, Журбин Е.А.2
-
Учреждения:
- Военный инновационный технополис «ЭРА»
- Военный инновационный технополис «Эра»
- Выпуск: Том 24, № 3 (2022)
- Страницы: 547-556
- Раздел: Научные обзоры
- Статья получена: 23.05.2022
- Статья одобрена: 21.08.2022
- Статья опубликована: 15.10.2022
- URL: https://journals.eco-vector.com/1682-7392/article/view/108133
- DOI: https://doi.org/10.17816/brmma108133
- ID: 108133
Цитировать
Полный текст
![Открытый доступ](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_open.png)
![Доступ закрыт](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_unlock.png)
![Доступ закрыт](https://journals.eco-vector.com/lib/pkp/templates/images/icons/text_lock.png)
Аннотация
Рассматриваются наиболее значимые однонуклеотидные полиморфизмы генов лейкоцитарного антигена человека и генов врожденного иммунитета, ассоциированные с различной степенью тяжести течения острой респираторной инфекции — COVID-19, вызываемой коронавирусом SАRS-CoV-2. По мере накопления данных стало ясно, что вирус SARS-CoV-2 проявляет значительную региональную, этническую и индивидуальную специфичность. Это связано с генетическими особенностями популяционных групп. Для более успешной терапии и вакцинопрофилактики инфекции требуется достоверно знать связь генотипа человека со степенью тяжести течения СОVID-19 (бессимптомная, легкая, среднетяжелая, тяжелая, крайне тяжелая вплоть до летальных исходов). При этом также известно, что система врожденного иммунитета стоит на первой линии защиты от проникновения в организм патогенных возбудителей, а система лейкоцитарного антигена человека кодирует одноименные молекулы на поверхности клеток, которые осуществляют презентацию различных антигенов, в том числе возбудителей вирусных инфекций, и определяют тяжесть течения многих заболеваний, поэтому для анализа были выбраны гены этих систем. Такой подход позволяет оценить вероятность тяжелого и крайне тяжелого течения заболевания у здоровых и зараженных людей, что в свою очередь способствует правильному выстраиванию стратегию терапии, фармакотерапии пациентов и вакцинопрофилактики населения, а также созданию новых противовирусных как терапевтических, так и профилактических лекарственных средств. Вместе с тем генетически обусловленная гетерогенность иммунного ответа на инфекцию SARS-CoV-2 требует дальнейшего изучения, так как нет однозначного мнения о ведущем механизме, который определяет тяжесть заболевания.
Полный текст
ВВЕДЕНИЕ
В начале декабря 2019 г. в китайской провинции Хубэй были зарегистрированы случаи тяжелого острого респираторного синдрома, связанного с коронавирусом 2 (severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 — SARS-CoV-2), способным вызывать у людей тяжелые (вплоть до летальных) первичные вирусные пневмонии. Первый случай такой пневмонии был официально зарегистрирован в г. Ухань 8 декабря 2019 г. [1]. Уже 30 декабря 2019 г. медицинское управление городского комитета здравоохранения г. Ухань уведомило о появлении пневмонии неизвестной этиологии. 12 января 2020 г. заболевание получило название Coronavirus disease 2019 (COVID-19) [2]. К началу 2022 г. в мире зарегистрировано более 400 млн случаев COVID-19 и приблизительно 6 млн смертей [3]. В России к этому времени заразилось 18 379 583 человек, из которых 380 076 умерли1.
В литературе обнаружены данные о наличии в генотипе человека некоторых полиморфных вариантов генов, которые могут влиять на тяжесть течения и летальность заболевания COVID-19. Каждый однонуклеотидный полиморфизм генов различных групп может иметь значение при выявлении предрасположенности к более тяжелому течению заболевания и определении стратегии вакцинопрофилактики [4–6].
Цель исследования — выявить наиболее значимые однонуклеотидные полиморфизмы генов лейкоцитарного антигена человека (human leukocyte antigen — HLA) и генов врожденного иммунитета, ассоциированные с различной степенью тяжести течения COVID-19.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Изучена отечественная и зарубежная научная литература, отражающая роль полиморфизмов генов HLA и врожденного иммунитета, ассоциированных с разной степенью тяжести течения коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CоV-2.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
Иммунная реакция на коронавирусную инфекцию. Роль врожденного иммунитета. При попадании в организм вируса SARS-CoV-2 первичный иммунный ответ осуществляется посредством активации толл-подобных рецепторов (рецепторы врожденного иммунитета), принадлежащих семейству рецепторов врожденного иммунитета. Помимо этого, они участвуют в регуляции экспрессии цитокинов, непрямой активации адаптивной иммунной системы и распознавании молекулярных паттернов, ассоциированных с патогенами [5, 7]. Затем активируются воспалительные пути, включая клеточный сигнальный путь интерферона (IFN), фактора некроза опухоли α — ядерный путь фактор-каппа, путь толл-подобного рецептора, путь Т-клеточного рецептора, путь янус-киназа — преобразователь сигналов и активатор транскрипции (janus kinase — signal transducer and activator of transcription — JAK-STAT) и т. д. Низкие уровни противовирусных интерферонов, высокие уровни провоспалительных цитокинов (интерлейкинов (ИЛ) 1β, ИЛ-2R, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-17 и фактора некроза опухоли-α) и хемокинов (CCL-2, CCL-3, CCL-5, CCL-7, CXCL-10) продуцируются различными иммунологическими клетками при контакте с вирусом [6–11]. Чрезмерная секреция этих цитокинов из провоспалительных клеток приводит к неконтролируемой воспалительной реакции, которая играет ключевую роль в патогенезе COVID-19 и осложняет течение инфекции [12].
Клеточный сигнальный путь IFN является основным врожденным иммунным ответом для предотвращения репликации вируса на ранних стадиях заражения [12]. Интерфероны участвуют в передаче сигналов через сигнальный путь JAK-STAT (в основном гены JAK1 и JAK2), что вызывает активацию различных генов и белков, таких как ИЛ-6 и прочих, контролируемых IFN, для инактивации вирусов в клетках-хозяевах. При этом путь JAK/STAT является главным сигнальным путем цитокинов и играет ключевую роль в развитии цитокинового шторма [11]. Этот путь преобразует внеклеточные сигналы в транскрипционные ответы [12]. Нарушение регуляции передачи сигналов JAK/STAT приводит к аномальным иммунным реакциям. Ингибирование JAK играет основополагающую роль в снижении уровня цитокинов [13].
С прогрессированием цитокинового шторма у пациентов, страдающих COVID-19, связана дисфункция ренин-ангиотензиновой системы [10]. Связывание S-белка SARS-CoV-2 с ангиотензинпревращающим ферментом 2 (АПФ2) приводит к снижению его экспрессии и поражению легких [4, 14].
Ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов генов врожденного иммунитета. При исследовании иммунопатологических изменений у пациентов, страдающих COVID-19, выявлена связь непрерывно активирующихся IFN с тяжелой формой заболевания [2, 6, 7]. При этом более высокий уровень IFNγ наблюдался у переболевших пациентов по сравнению с пациентами со смертельным исходом [15]. Также показано, что у пациентов с легким течением заболевания обнаружена положительная корреляция с экспрессией нескольких участков IFN-III, что не наблюдалось у пациентов с тяжелой и крайне степенью тяжести заболевания. Исходя из этого, изменения в генах, отвечающих за врожденный иммунитет, могут привести к высокой восприимчивости организма человека к вирусу SARS-CoV-2 [16, 17].
Установлена ассоциация генетического маркера rs12979860 гена IFNL4 (interferon lambda 4) с риском развития заболевания COVID-19. Так, аллель Т был значительно сверхэкспрессирован у пациентов, страдающих COVID-19, по сравнению с контрольной группой здоровых людей. Частота генотипа СС была значительно выше в группе здоровых людей по сравнению с переболевшими (55,51 и 37,85% соответственно) [18]. Полиморфизм rs8099917 гена IFNL4, где частота аллеля Т по сравнению с G значительно выше у пациентов, переболевших COVID-19 (0,808 и 0,429 соответственно), чем у здоровых. Такие же выводы можно сделать об аллеле A однонуклеотидного полиморфизма гена IFNL4 rs12980275, так как его частота встречаемости среди переболевших пациентов выше, чем среди умерших (0,774 и 0,428 соответственно) по сравнению с G аллелем [19].
Показано, что пациенты с генотипом СС гена IFNL3 rs12979860 имеют более высокий риск инфицирования COVID-19 по сравнению с контрольной группой. Однако генотип TC связан с более тяжелыми симптомами и высоким уровнем летальности по сравнению с другими генотипами. У пациентов с генотипами ТС и СС заболевание чаще проходит в тяжелой форме по сравнению со случаями ТТ генотипа. Эти данные свидетельствуют о том, что врожденный иммунитет тесно связан с исходом инфекции SARS-CoV-2 [20].
Также установлена ассоциация ответа хозяина на инфекцию SARS-CoV-2 в сербской популяции полиморфизмов в генах: rs5030737, rs1800450 и rs1800451 в гене лектин, связывающий маннозу 2 (mannose binding lectin 2 — MBL2), его роль заключается в распознавании паттернов в первой линии защиты, и rs751350524, rs753837415 и rs1021340095 в гене 2’-5’-олигоаденилатсинтетаза 1 (2’-5’-oligoadenylate synthetase 1 — OAS1, который активирует латентную РНКазу L, что приводит к деградации вирусной РНК и ингибированию репликации вируса [20]. На основании однородности выборки в исследовании из европеоидной популяции сделаны выводы, что два варианта с потенциально повреждающим действием: rs5030737 и rs1800451 гена MBL2, имеющие аллельную частоту 8 и 14% соответственно — являются популяционно-специфичными маркерами, которые следует рассматривать для изучения ассоциации у пациентов, страдающих COVID-19, в европейской популяции [21, 22]. Также показано, что две однонуклеотидные замены rs10735079(A) и rs6489867(T), которые связаны со сниженной экспрессией гена OAS1, имеют высокий уровень ассоциации с тяжелым течением COVID-19 [23].
Однонуклеотидный полиморфизм rs12252-C/C в гене интерферон-индуцированный трансмембранный белок 3 (interferon-induced transmembrane protein 3 — IFITM3, который является фактором риска тяжелого гриппа, также был обнаружен у пациента, страдающего COVID-19 [24]. Индуцированный IFN трансмембранный белок-3 генетического варианта rs12252-C связан с тяжестью заболевания COVID-19. Гомозиготы по аллелю С rs12252 в гене IFITM3 ассоциируются с более тяжелым течением заболевания в зависимости от возраста, что подтверждает роль IFITM3 в патогенезе заболевания [24].
Гликопротеин AHSG (α2-Heremans-Schmid glycoprotein), необходимый для дезактивации макрофагов эндогенными катионами, связан с регуляцией воспалительного процесса [25]. Вариант rs2248690 гена AHSG влияет на транскрипционную активность промотора гена AHSG и, таким образом, регулирует уровень белка AHSG в крови [22]. Генотип AA rs2268690 связан с более высокой концентрацией белка AHSG в крови и является протективным для развития тяжелого острого респираторного синдрома. Корме того, вариант rs2248690 ассоциирован с восприимчивостью к атипичной пневмонии [25, 26].
Имеет место ассоциация между тяжестью течения COVID-19 и аллелями rs8176747, rs41302905, и rs8176719, определяющими группы крови в китайской популяции [25]. Кровь выполняет защитную функцию, являясь одним из основных факторов иммунитета [22]. Показано, что у носителей 0(I) реже наблюдается тяжелое течение COVID-19, и, наоборот, у носителей А(II) оно возникает чаще [27].
Фермент дипептидилпептидаза 4 (dipeptidyl peptidase-4 — DPP4) является внутримембранным гликопротеином и сериновой экзопептидазой, участвует в нескольких физиологических процессах, включая регуляцию метаболизма глюкозы, инсулина, а также в иммунной реакции. Был обнаружен однонуклеотидный полиморфизм гена DPP4 (rs13015258 — C аллель), который ассоциируется с высокой экспрессией и ростом летальности среди пациентов, страдающих COVID-19 на фоне сахарного диабета 2-го типа [28].
Генетические полиморфизмы генов HLA. Комплекс генов HLA — это локус генов, расположенный на 6-й хромосоме, который кодирует белки, известные как основной комплекс гистосовместимости (major histocompatibility complex — MHC). Они представляют собой специфическую группу молекул, экспрессируемых на поверхность клеток и имеющих решающее значение для распознавания несамостоятельных молекул приобретенной иммунной системой [29–31]. Основная функция MHC — связывать и раскрывать антигены, полученные от патогенов, чтобы репрезентировать их соответствующим Т-лимфоцитам, активируя иммунный ответ организма. В частности, молекулы MHC I класса раскрывают пептидные антигены, присутствующие в цитоплазме, активируя ответ Т-клеток, а молекулы MHC II класса раскрывают пептидные антигены, присутствующие во внеклеточном пространстве, также активируя ответ Т-клеток [31, 32].
Ассоциацию полиморфизмов генов группы HLA с тяжестью протекания коронавирусной инфекции подтверждают исследования сродства связывания молекул HLA с вирусными пептидами [33–35]. Также показана высокая вероятность осложненного течения COVID-19 для пациентов, имеющих полиморфизмы HLA-B*46:01, HLA-A*25:01 и HLA-C*01:02, и, напротив, низкая вероятность при полиморфизмах HLA-A*02:02, HLA-B*15:03 и HLAC*12:03 [33]. Полиморфизмы антигенов системы HLA, такие как HLAB*07:03, HLA-DRB1*12:02 и HLA-Cw*08:01, высокоассоциированы с восприимчивостью к коронавирусам, в то время как аллели HLA-DPB1*03:01 и HLACw*15:02 связаны с низким риском развития коронавирусной инфекции. Аллель HLA-A*01:01 связан с высоким риском летального исхода, тогда как HLA-A*03:01 — с низким. Гомозиготность по аллелю HLA-A*01:01 ассоциирована со смертельным исходом инфицированных COVID-19 [34].
Были найдены ассоциации между HLA-A*02:01 генотипом, определяющим сравнительно низкую связывающую способность с SARSCoV-2 антигенами, по сравнению с индивидуумами с генотипом HLAA*11:01 или HLA-A*24:01, развивающими более эффективный T-клеточный опосредованный противовирусный ответ на инфекцию [36]. Вместе с тем в популяциях, например, на территории Японии, где был более распространен генотип HLA-А*02:01, отмечалась статистически значимая более высокая заболеваемость COVID-19 по сравнению с теми, где преобладал генотип HLA-A*24:02 и HLAA*11:01 (Океания и др.) [37].
Исследования генотипов пациентов, больных COVID-19, позволили выявить группы рисковых (полиморфизмы, ассоциированные с тяжелым и осложненным течением болезни) и протективных (полиморфизмы, ассоциированные с легкими бессимптомным течением болезни) полиморфизмов (табл. 1). Данные об ассоциации со степенью тяжести течения COVID-19 полиморфизмов HLA-B*54:01, HLAA*02:04 остаются противоречивыми [38–40].
Таблица 1. Полиморфизмы генов HLA, ассоциированные с вероятностью различного течения COVID-19
Table 1. Polymorphisms of HLA genes associated with the probability of different COVID-19 course
Рисковые полиморфизмы | Протективные полиморфизмы |
HLA-A*01:01 [34] | |
HLA-A*25 [38] | HLA-A*02:03 [38] |
HLA-A*25:01 [38] | |
HLA-A*25:02 [29] | |
HLA-B*08 [39] | HLA-A*02:09 [38] |
HLA-B*15:01 [29] | HLA-A*02:11 [38] |
HLA-A*02:12 [29] | |
HLA-B*27:07 [39] | HLA-A*02:22 [29] |
HLA-A*02:24 [29] | |
HLA-B*51 [38] | HLA-A*02:35 [29] |
HLA-B*55:01 [38] | HLA-A*02:40 [29] |
HLA-B*55:07 [41] | HLA-A*11:01 [39] |
HLA-B*55:12 [41] | |
HLA-B*56:01 [41] | HLA-B*14 [38] |
HLA-B*18 [29] | |
HLA-C*03 [29] | HLA-В*49 [29] |
HLA-C*04:01 [38] | HLA-B*52:01 [29] |
HLA-C*05 [34] | HLA-C*12:02 [39] |
HLA-DRB1*01:01 [41] | HLA-C*12:03 [39] |
HLA-DRB1*14:04 [38] | HLA-DRB1*12:01 [40] |
HLA-DRB1*15:01 [38] | HLA-DPB1*03:01 [40] |
HLA-DQA1*01:01 [41] | HLA-A*03:01 [39] |
HLA-DQA1_509 [41] | |
HLA-B*07:03 [40] | |
HLA-DQB1*06:02 [41] | HLA-Cw*15:02 [40] |
HLA-DRB1*12:02 [40] | HLA-A*24:01 [39] |
HLA-Cw*08:01 [40] | HLA-A*11:01 [39] |
Отмечено, что HLA-A и HLA-C обладают относительно большей и наименьшей способностью репрезентировать SARS-CoV-2 соответственно, а HLA-B преимущественно включает восприимчивость к COVID-19. Люди с аллелями HLA-A*25:01, HLA-A*25:02, HLA-B*46:01, HLAC*01:02 более предрасположены к инфицированию COVID-19 [29, 36, 39].
Аллели HLA-A*02:02, HLA-A*02:03, HLAA*02:05, HLA-A*02:06, HLA-A*02:09, HLA- A*02:11, HLA-A*02:12, HLA-A*02:22, HLA-A*02:24, HLA-A*02:35 и HLA-A*02:40, а также HLAA*24:02, HLA-B*15:03, HLAB*52:01, HLA-C*12:02 и HLA-C*12:03 являются протективными, так как связывают фрагменты патогенных пептидов [29, 34, 38].
Аллель HLA-B*15:03 обеспечивает более эффективный перекрестный Т-клеточный иммунитет. Полиморфизмы HLA-A*25, HLA-B*08, HLA-B*15:01, HLA-B*15:27, HLA-B*27:07, HLA-B*44, HLAB*51, HLAC*01, HLA-C*03, HLA-C*04:01, HLA-DRB1*15:01, HLADQA1_509, HLADQB1*04 и HLA-DQB1*06:02 были связаны с крайне тяжелым протеканием заболевания и смертельным исходом, в то время как HLA-B*14, HLAB*18 и HLA-B*49 показали обратную логарифмически-линейную связь с COVID-19 [29, 38, 41].
Также выявлены два гаплотипа, HLA-A*02:05-B*58:01-DRB1*08:01 и HLA-A*02:05-B*58:01-C*07:01, защищающие от тяжелых последствий COVID-19. Многие ученые предлагают одновременно проводить HLA-типирование и тестирование на COVID-19 для определения группы риска, чтобы вакцинировать в первую очередь лиц с высоким риском тяжелого течения заболевания в соответствии с данными генетических исследований [39, 40, 42].
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Изучение полиморфизмов, рассмотренных в данной статье, позволит оценить вероятность тяжелого и крайне тяжелого течения заболевания COVID-19, что в свою очередь будет способствовать правильно выстроенной стратегии терапии, фармакотерапии пациентов и вакцинопрофилактики населения, а также созданию новых противовирусных как терапевтических, так и профилактических лекарственных средств. Генетически обусловленная гетерогенность иммунного ответа на инфекцию SARS-CoV-2 требует дальнейшего изучения, так как нет однозначного мнения о ведущем механизме, который определяет тяжесть заболевания. Так как гены HLA по-разному влияют на протекание COVID-19, то и вакцины против него могут иметь различную степень связывания с разными генотипами HLA в разных популяциях. Прогнозирование хорошего связывания определенных аллелей HLA и нахождение ведущего механизма иммунного ответа будут способствовать разработке наиболее эффективной вакцины.
1 Коронавирус-монитор — интерактивная карта распространения и статистика COVID-19 по данным Роспотребнадзора РФ. [Дата обращения: 11.07.2022]. Доступ по ссылке: https://coronavirus-monitor.info/country/russia.
Об авторах
Александр Михайлович Бутусов
Военный инновационный технополис «ЭРА»
Email: butus98@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-3074-2449
магистр
Россия, АнапаОльга Владимировна Круско
Военный инновационный технополис «ЭРА»
Email: panarinaolya08@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9111-7914
SPIN-код: 4702-6002
кандидат биологических наук
Россия, АнапаПетр Кириллович Потапов
Военный инновационный технополис «ЭРА»
Email: forwardspb@mail.ru
SPIN-код: 5979-4490
кандидат медицинских наук
Россия, АнапаДмитрий Сергеевич Деревянкин
Военный инновационный технополис «ЭРА»
Email: derev.dima1@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0370-0347
магистр
Россия, АнапаВалентин Дмитриевич Заграничнов
Военный инновационный технополис «ЭРА»
Email: valentin.zagranichnov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0238-8486
ординатор
Россия, АнапаСвятослав Сергеевич Малышкин
Военный инновационный технополис «ЭРА»
Автор, ответственный за переписку.
Email: svytoslavmal@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4366-0028
SPIN-код: 8109-3446
магистр
Россия, АнапаЕвгений Александрович Журбин
Военный инновационный технополис «Эра»
Email: zhurbin-90@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0867-3838
SPIN-код: 8426-1354
Scopus Author ID: 57198886746
кандидат медицинских наук
Россия, АнапаСписок литературы
- Ryu S., Chun B.C. An interim review of the epidemiological characteristics of 2019 novel coronavirus // Epidemiology and Health. 2020. Vol. 42. ID e2020006. doi: 10.4178/epih.e2020006
- Москалев А.В., Гумилевский Б.Ю., Апчел В.Я., Цыган В.Н. Старый новый коронавирус // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2020. Т. 22, № 2. С. 182–188. doi: 10.17816/brmma50070
- Зайковская А.В., Гладышева А.В., Карташов М.Ю., и др. Изучение в условиях in vitro биологических свойств штаммов коронавируса SARS-CoV-2, относящихся к различным генетическим вариантам // Проблемы особо опасных инфекций. 2022. № 1. С. 94–100. doi: 10.21055/0370-1069-2022-1-94-100
- Saponaro F., Rutigliano G., Sestito S., et al. ACE2 in the era of SARS-CoV-2: Controversies and novel perspectives // Front Mol Biosci. 2020. Vol. 7. ID e588618. doi: 10.3389/fmolb.2020.588618
- Khanmohammadi S., Rezaei N. Role of Toll-like receptors in the pathogenesis of COVID-19 // J Med Virol. 2021. Vol. 93, No. 5. P. 2735–2739. doi: 10.1002/jmv.26826
- Iwasaki A., Medzhitov R. Toll-like receptor control of the adaptive immune responses // Nat Immunol. 2004. Vol. 5, No. 10. P. 987–995. doi: 10.1038/ni1112
- Москалев А.В., Гумилевский Б.Ю., Апчел А.В., Цыган В.Н. Паттерн-распознающие рецепторы и их сигнальные пути в реализации механизмов врожденного иммунитета при вирусных инфекциях // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2022. Т. 24, № 2. С. 381–389. doi: 10.17816/brmma91018
- Van Der Made C.I., Simons A., Schuurs-Hoeijmakers J., et al. Presence of genetic variants among young men with severe COVID-19 // JAMA. 2020. Vol. 324, No. 7. P. 663–673. doi: 10.1001/jama.2020.13719
- Zhang C., Wu Z., Li J.-W., et al. Cytokine release syndrome in severe COVID-19: interleukin-6 receptor antagonist tocilizumab may be the key to reduce mortality // Int J Antimicrob Agents. 2020. Vol. 55, No. 5. ID 105954. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2020.105954
- Ye Q., Wang B., Mao J. The pathogenesis and treatment of the ‘Cytokine Storm’ in COVID-19 // J Infect. 2020. Vol. 80, No. 6. P. 607–613. doi: 10.1016/j.jinf.2020.03.037
- Richardson P.J., Corbellino M., Stebbing J. Baricitinib for COVID-19: a suitable treatment? // Lancet Infect Dis. 2020. Vol. 20, No. 9. P. 1013–1014. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30270-X
- Tian Y., Rong L., Nian W., He Y. Gastrointestinal features in COVID-19 and the possibility of faecal transmission // Aliment Pharmacol Ther. 2020. Vol. 51, No. 9. P. 843–851. doi: 10.1111/apt.15731
- McElvaney O.J., McEvoy N.L., McElvaney O.F., et al. Characterization of the inflammatory response to severe COVID-19 illness // Am J Respir Crit Care Med. 2020. Vol. 202, No. 6. P. 812–821. doi: 10.1164/rccm.202005-1583OC
- Гумилевский Б.Ю., Москалев А.В., Гумилевская О.П., и др. Особенности иммунопатогенеза новой коронавирусной инфекции // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2021. Т. 23, № 1. C. 187–198. doi: 10.17816/brmma63654
- Chen Y.-M., Zheng Y., Yu Y., et al. Blood molecular markers associated with COVID-19 immunopathology and multi-organ damage // EMBO J. 2020. Vol. 39, No. 24. ID e105896. doi: 10.15252/embj.2020105896
- Sposito B., Broggi A., Pandolfi L., et al. The interferon landscape along the respiratory tract impacts the severity of COVID-19 // Cell. 2021. Vol. 184, No. 19. P. 4953–4968. doi: 10.1016/j.cell.2021.08.016
- Миннуллин Т.И., Степанов А.В., Чепур С.В., и др. Иммунологические аспекты поражения коронавирусом SARS-CoV-2 // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2021. Т. 23, № 2. C. 187–198. doi: 10.17816/brmma72051
- Saponi-Cortes J.M.R., Rivas M.D., Calle-Alonso F., et al. IFNL4 genetic variant can predispose to COVID-19 // Sci Rep. 2021. Vol. 11. ID 21185. doi: 10.1038/s41598-021-00747-z
- Rahimi P., Tarharoudi R., Rahimpour A., et al. The association between interferon lambda 3 and 4 gene single-nucleotide polymorphisms and the recovery of COVID-19 patients // Virol J. 2021. Vol. 18. ID 221. doi: 10.1186/s12985-021-01692-z
- Agwa S.H.A., Kamel M.M., Elghazaly H., et al. Association between interferon-lambda-3 rs12979860, TLL1 rs17047200 and DDR1 rs4618569 variant polymorphisms with the course and outcome of SARS-CoV-2 patients // Genes. 2021. Vol. 12, No. 6. P. 830. doi: 10.3390/genes12060830
- Grimaudo S., Amodio E., Pipitone R.M., et al. PNPLA3 and TLL-1 polymorphisms as potential predictors of disease severity in patients with COVID-19 // Front Cell Dev Biol. 2021. Vol. 9. P. 1589. doi: 10.3389/fcell.2021.627914
- Klaassen K., Stankovic B., Zukic B., et al. Functional prediction and comparative population analysis of variants in genes for proteases and innate immunity related to SARS-CoV-2 infection // Infect Genet Evol. 2020. Vol. 84. ID 104498. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104498
- Magusali N., Graham A.C., Piers T.M., et al. A genetic link between risk for Alzheimer's disease and severe COVID-19 outcomes via the OAS1 gene // Brain. 2021. Vol. 144, No. 12. P. 3727–3741. doi: 10.1093/brain/awab337
- Zhang Y., Qin L., Zhao Y., et al. Interferon-induced transmembrane protein 3 genetic variant rs12252-C associated with disease severity in coronavirus disease 2019 // J Infect Dis. 2020. Vol. 222, No. 1. P. 34–37. doi: 10.1093/infdis/jiaa224
- Zhu X., Wang Y., Zhang H., et al. Genetic variation of the human α-2-Heremans-Schmid glycoprotein (AHSG) gene associated with the risk of SARS-CoV infection // PloS One. 2011. Vol. 6, No. 8. ID E23730. doi: 10.1371/journal.pone.0023730
- Крюков Е.В., Салухов В.В., Котив Б.Н., и др. Факторы, влияющие на содержание IgG-антител к S-белку SARS-CoV-2 в крови у реконвалесцентов после новой коронавирусной инфекции (COVID-19) // Медицинский совет. 2022. № 4. С. 51–65. doi: 10.21518/2079-701X-2022-16-4-51-65
- Wu Y., Feng Z., Li P., Yu Q. Relationship between ABO blood group distribution and clinical characteristics in patients with COVID-19 // Clin Chim Acta. 2020. Vol. 509. P. 220–223. doi: 10.1016/j.cca.2020.06.026
- Senapati S., Kumar S., Singh A.K., et al. Assessment of risk conferred by coding and regulatory variations of TMPRSS2 and CD26 in susceptibility to SARS-CoV-2 infection in human // J Genet. 2020. Vol. 99. ID 53. doi: 10.1007/s12041-020-01217-7
- Deng H., Yan X., Yuan L. Human genetic basis of coronavirus disease 2019 // Signal Transduct Target Ther. 2021. Vol. 6. ID 344. doi: 10.1038/s41392-021-00736-8
- Kulski J.K., Shiina T., Dijkstra J.M. Genomic diversity of the major histocompatibility complex in health and disease // Cells. 2019. Vol. 8, No. 10. P. 1270. doi: 10.3390/cells8101270
- Ambagala A.P.N., Solheim J.C., Srikumaran S. Viral interference with MHC class I antigen presentation pathway: the battle continues // Vet Immunol Immunopathol. 2005. Vol. 107, No. 1-2. P. 1–15. doi: 10.1016/j.vetimm.2005.04.006
- Yewdell J.W., Hill A.B. Viral interference with antigen presentation // Nat Immunol. 2002. Vol. 3, No. 11. P. 1019–1025. doi: 10.1038/ni1102-1019
- Nguyen A., David J.K., Maden S.K., et al. Human leukocyte antigen susceptibility map for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 // J Virol. 2020. Vol. 94, No. 13. ID e00510-20. doi: 10.1128/JVI.00510-20
- Shkurnikov M., Nersisyan S., Jankevic T., et al. Association of HLA class I genotypes with severity of coronavirus disease-19 // Front Immunol. 2021. Vol. 12. P. 423. doi: 10.3389/fimmu.2021.641900
- Ивченко Е.В., Котив Б.Н., Овчинников Д.В., Буценко С.А. Результаты работы научно-исследовательского института проблем новой коронавирусной инфекции Военно-медицинской академии за 2020–2021 гг. // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2021. Т. 23, № 4. C. 93–104. doi: 10.17816/brmma83094
- Tomita Y., Ikeda T., Sato R., Sakagami T. Association between HLA gene polymorphisms and mortality of COVID-19: An in silico analysis // J Virol. 2020. Vol. 94, No. 13. ID e00510-20. doi: 10.1002/iid3.358
- Mohammadpour S., Torshizi Esfahani A., Halaji M., et al. An updated review of the association of host genetic factors with susceptibility and resistance to COVID-19 // J Cell Physiol. 2020. Vol. 236, No. 1. P. 49–54. doi: 10.1002/jcp.29868
- Debnath M., Banerjee M., Berk M. Genetic gateways to COVID-19 infection: Implications for risk, severity, and outcomes // FASEB J. 2020. Vol. 34, No. 7. P. 8787–8795. doi: 10.1096/fj.202001115R
- Kiyotani K., Toyoshima Y., Nemoto K., Nakamura Y. Bioinformatic prediction of potential T cell epitopes for SARS-Cov-2 // J Hum Genet. 2020. Vol. 65, No. 7. P. 569–575. doi: 10.1038/s10038-020-0771-5
- Pisanti S., Deelen J., Gallina A.M., et al. Correlation of the two most frequent HLA haplotypes in the Italian population to the differential regional incidence of COVID-19 // J Transl Med. 2020. Vol. 18. ID 352. doi: 10.1186/s12967-020-02515-5
- Migliorini F., Torsiello E., Spiezia F., et al. Association between HLA genotypes and COVID-19 susceptibility, severity and progression: a comprehensive review of the literature // Eur J Med Res. 2021. Vol. 26. ID 84. doi: 10.1186/s40001-021-00563-1
- Жоголев С.Д., Горенчук А.Н., Кузин А.А., и др. Оценка иммуногенности и реактогенности вакцины «Спутник V» при ее применении у военнослужащих // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2021. Т. 23, № 4. С. 147–152. doi: 10.17816/brmma80760
Дополнительные файлы
![](/img/style/loading.gif)