ГЕНОМНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ STREPTOCOCCUS DYSGALACTIAE SUBSPECIES EQUISIMILIS



Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis является наиболее распространенным представителем стрептококков группы G и важным этиологическим агентом многих заболеваний человека. Несмотря на опубликование полногеномной последовательности S. dysgalactiae subsp. equisimilis, данные о генетической гетерогенности этого подвида практически отсутствуют в современной литературе. В настоящей работе проведен сравнительный анализ большой коллекции штаммов S. dysgalactiae subsp. equisimilis, выделенных в различных географических регионах. Проанализировано наличие генов вирулентности scpG, lmb, nga, speG и ska. Обнаружена выраженная гетерогенность гена scpG. Осуществлено emm-генотипирование ряда штаммов. Проведен анализ штаммов методом электрофореза в пульсирующем электрическом поле. В результате работы выявлен значительный геномный полиморфизм S. dysgalactiae subsp. equisimilis.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Юрий Юриевич Ильясов

Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН

Email: kolpino@hotmail.com
Санкт-Петербург, Россия

А В Дмитриев

Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН

Санкт-Петербург, Россия

Список литературы

  1. Broyles L. N., Van Beneden C., Beall B. et al. Populaion-based study of invasive disease due to P-hemolytic streptococci of groups other than A and B // Clin. Infect. Dis.- 2009.- Vol. 48.- P. 706-712.
  2. Facklam R. What happened to streptococci: overview of taxonomic and nomenclature changes // Clin. Microbiol. Rev.- 2002.- Vol. 15.-P. 613-630.
  3. Ruoff K. L., Whiley R. A., Beighton D. Streptococcus // Manual of clinical microbiology.- 2003.- P. 405-421.
  4. Lancefield R. C., Hare R. The serological differentiation of pathogenic and non-pathogenic streptococci from parturient woman // J. Exp. Med.- 1935.- Vol. 61.- P. 335 -349.
  5. Nohlgard C., Bjorklind A., Hammar H. Group G streptococcal infections on a dermatological ward // Acta Derm. Venereol.- 1992.- Vol. 72.- P. 128-130.
  6. Alberti 5., Garcia-Rey C., Garcia-Laorden M. I. et al. The Spanish surveillance group for respiratory pathogens: survey of emm-like gene sequences from pharyngeal isolates of group C and group G streptococci collected in Spain // J. Clin. Microbiol.- 2005.- Vol. 43.-P. 1433-1436.
  7. Reissmann S., Friedrichs C., Rajkumari R. et al. Contribution of Streptococcus anginosus to infections caused by groups C and G streptococci in Southern India // Emerg. Infect. Dis.- 2010.- Vol. 16.- P. 656-663.
  8. Barnham M. R. D., Weightman N. C., Anderson A. W., Tanna A. Streptococcal toxic shock syndrome: a description of 14 cases from North Yorkshire, UK // Clin. Microbiol. Infect.- 2002.- Vol. 8.- P. 174-181.
  9. Hashikawa S., Iinuma Y., Furushita M. et al. Characterization of group C and G streptococcal strains that cause streptococcal toxic shock syndrome // J. Clin. Microbiol.- 2004.- Vol. 42.- P. 186-192.
  10. Natoli S., Fimiani C., Faglieri N. et al. Toxic shock syndrome due to group C streptococci. A case report // Intensive Care Med.- 1996.-Vol. 22.- P. 985-989.
  11. Wagner J. G., Schlievert P. M., Assimacopoulos A. Р. et al. Acute group G streptococcal myositis associated with streptococcal toxic shock syndrome: case report and review // Clin. Infect. Dis.- 1996.- Vol. 23.- P. 1159-1161.
  12. Collins C. M., Kimura A, Bisno A. L. Group G streptococcal M protein exhibits structural features analogous to those of class I M protein of group A streptococci // Infect. Immun.- 1992.- Vol. 60.- P. 3689-3696.
  13. McDonald M., Towers R. J., Andrews R. M. et al. Epidemiology of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis in tropical communities, Northern Australia // Emerg. Infect. Dis.- 2007.- Vol. 13.- P. 1694-1700.
  14. Rato M. G., Nerlich A., Bergmann R. et al. Virulence gene pool detected in bovine group C Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae isolates by use of a group A S. pyogenes virulence microarray // J. Clin. Microbiol.- 2011.- Vol. 49.- P. 2470-2479.
  15. Timmer A. M., Kristian S. A., Datta V. et al. Serum opacity factor promotes group A streptococcal epithelial cell invasion and virulence // Mol. Microbiol.- 2006.- Vol. 62.- P. 15-25.
  16. Ильясов Ю. Ю., Biswas I., Тотолян A. A., Дмитриев А. В. Метод дифференциальной диагностики стрептококков групп С и G // Клиническая лабораторная диагностика.- 2011.- № 2.- С. 40-43.
  17. Jensen A., Kilian M. Delineation of Streptococcus dysgalactiae, its subspecies, and its clinical and phylogenetic relationship to Streptococcus pyogenes // J. Clin. Microbiol.- 2012.- Vol. 50.- P. 113-126.
  18. Lefebure T., Richards V. P., Lang P. et al. Gene repertoire evolution of Streptococcus pyogenes inferred from phylogenomic analysis with Streptococcus canis and Streptococcus dysgalactiae // PLoS One.- 2012.- Vol. 7.- e37607.
  19. Дмитриев А. В., Hu Y. Y., Shen A. D. и др. Анализ клинических штаммов стрептококков группы В методами молекулярной генетики // Медицинский академический журнал.- 2002.- Т. 2, № 2.- С. 18-27.
  20. Dmitriev A. V., Shakleina E., Tkacikova L. et al. Genetic heterogeneity of the pathogenic potentials of human and bovine group B streptococci // Folia Microbiol.- 2002.- Vol. 47.- P. 291-295.
  21. Dmitriev A.V., Suvorov A. N., Shen A.D., Yang Y. H. Clinical diagnosis of group B streptococci by scpB gene based PCR // Indian. J. Med. Res.- 2004.- Vol. 119 (suppl.).- P. 233-236.
  22. Koroleva I. V., Efstratiou A., Suvorov A. N. Structural heterogeneity of the streptococcal C5a peptidase gene in Streptococcus pyogenes // J. Bacteriol.- 2002.- Vol. 184.- P. 6384-6386.
  23. Beall B., Facklam R., Thompson T. Sequencing emm-specific PCR products for routine and accurate typing of group A streptococci // J. Clin. Microbiol.- 1996.- Vol. 34.- P. 953-958.
  24. Sunaoshi K., Murayama S. Y., Adachi K. et al. Molecular emm genotyping and antibiotic susceptibility of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis isolated from invasive and non-invasive infections // J. Med. Microbiol.- 2010.- Vol. 59.- P. 82-88.
  25. Davies M. R., McMillan D. J., Van Domselaar G. H. et al. Phage 3396 from a Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis pathovar may have its origins in Streptococcus pyogenes // J. Bacteriol- 2007.- Vol. 189.- P. 2646-2652.
  26. Beres S. B., Sylva G. L., Barbian K. D. et al. Genome sequence of a serotype M3 strain of group A Streptococcus: phage-encoded toxins, the high-virulence phenotype, and clone emergence // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2002.- Vol. 99.- P. 10078-10083.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Ильясов Ю.Ю., Дмитриев А.В., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 74760 от 29.12.2018 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах