Assessment of the state population gene pool of specially protected species Helicopsis striata (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) using DNA-markers

Cover Page
Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription or Fee Access

Abstract


With the use of DNA-markers (RAPD and ISSR) the gene pool of nineteen populations of specially protected relict species Helicopsis striata (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) in Southern Mid-Russian Upland was studied. These results demonstrate a high degree of subdivision of populations (Фst = 0,404, Gst = 0,358) and increased levels of homozygosity in a number of groups that live in the industrial zone and the steppe habitats. The significant correlation between the level of gene flow and geographic distances between populations (R = 0,571 ± 0,052) was found, this corresponds to isolation by distance model. The values of the effective number was calculated on the basis of index units. They were significantly lower than the effective number of not protected species of snail.

Full Text

Restricted Access

About the authors

Edward Anatoljevich Snegin

Belgorod national research university

Email: snegin@bsu.edu.ru
Dr. Biol. Sci., senior lecturer, head of department of biocenology and ecological genetics

References

  1. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях (2004). Под ред. Ю. П. Алтухова. М.: Наука.
  2. Красная книга Белгородской области. Редкие и исчезающие растения, грибы, лишайники и животные (2004). Под ред. А. В. Присного. Белгород.
  3. Крамаренко С. С., Крамаренко А. С. (2010) Аллозимный и RAPD полиморфизм наземных моллюсков Brephulopsis cilindrica (Enidae) в природных и урбанизированных местообитаниях юга Украины.Видовые популяции и сообщества в антропогенно трансформированных ландшафтах: состояние и методы его диагностики. Материалы XI международной научно-практической конференции. Белгород: ИПЦ Политерра, C. 210-211.
  4. Майр Э. Зоологический вид и эволюция (1968). М.: Мир.
  5. Николаев В. А. (1973) Наземные моллюски Среднерусской возвышенности. Дисс… канд. биол. наук. Орел, 240 с.
  6. Снегин Э. А. (2002) Использование видов наземных моллюсков в качестве индикаторов реликтовых ценозов. Вестник Житомирского педагогического университета. Вып. 10: С. 128-129.
  7. Снегин Э. А. (2010) Оценка состояния популяционных генофондов наземных моллюсков в условиях влияния горно-обогатительных комбинатов на примере Bradybaena fruticum Müll. (Gastropoda, Pulmonata). Экологическая генетика. 2010; Т. VIII. № 2. С. 45-55.
  8. Снегин Э. А. (2011 а) Генетическая структура популяций модельных видов наземных моллюсков в условиях урбанизированного ландшафта на примере Сhondrula tridens Müll. (Gastropoda, Pulmonata). кологическая генетика. 2011. Т. IX (2): С. 54-64.
  9. Снегин Э. А. (2011 б) Анализ генетической изменчивости популяций наземного моллюска Bradybaena fruticum Müll. с использованием RAPD и ISSR маркеров. Научные ведомости БелГУ Сер. Естественные науки. № 15 (110). Вып. 16. С. 37-43.
  10. Снегин Э. А. (2012) Пространственные и временные аспекты эколого-генетической структуры популяций беспозвоночных животных (на примере наземных моллюсков и насекомых юга Среднерусской возвышенности): Дис… докт. биол. наук. Белгород: НИУ БелГУ, 394 с.
  11. Снегин Э. А. (2013) Анализ генетической изменчивости популяций наземного моллюска Сhondrula tridens Müll. (Gastropoda, Pulmonata) с использованием RAPD и ISSR маркеров. Экологическая генетика. T. XI. № 3. С. 37-47.
  12. Снегин Э. А., Сычев А. А. (2011) Оценка жизнеспособности популяций особо охраняемого вида Helicopsis striata Müller (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) в условиях юга Среднерусской возвышенности. Теоретическая и прикладная экология. № 2: С. 84-93.
  13. Шилейко А. А. (1978) Наземные моллюски надсемейства Helicoidea. Фауна СССР. Моллюски. Л.: Наука. Т 3 (6): 384 с.
  14. Ewens W. (1972) The sampling theory of selectively neutral alleles. Theor. Pop. Biol. N 3. P. 87-112.
  15. Excoffier L., Smouse P. E., Quattro J. M. (1992) Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data. Genetics. N 131: Р. 479-491.
  16. Ložek V. (1980) Z červené knihy našich měkkýšů - suchomilka Helicopsis striata. Živa Academia Praha. V. 28 (6): P. 223.
  17. Manly B. F. J. (1985) The Statistics of Natural Selection on Animal Populations. London: Chapman and Hall.
  18. Nei M. (1972) Genetic distance between populations.The American Naturalist. V. 106 (949): P. 283-292.
  19. Nei M. (1975) Molecular population genetics and evolution. Amsterdam.
  20. Peakall R., Smouse P. E. (2001) GenAlEx V5: Genetic Analisis in Excel. Population genetic software for teaching and reseach. Australion National University, Canberra, Australia. http://www.anu.edu.au./BoZo/GenAlEx/.
  21. Slatkin M. (1993) Isolation by distance in equilibrium and non - equilibrium populations. Evolution. V. 47 (1): P. 294-279.
  22. Sparks B. W. (1953) The former occurrence of both Helicella striata (Müller) and H. geyeri (Soós) in England. Journal of Conchology. 1953. V. 23: P. 372-378.
  23. Stępczak K. (1999) Aktualny stan występowania Helicopsis striata (O. F. Müller, 1774) w dolinie Odry (Mollusca: Gastropoda) w Polsce. Bad. Fizjogr. Pol. Zach. V. 46: P. 7-21.
  24. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. (2011) MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution. http://www.kumarlab.net/publications.
  25. Watterson G. (1978) The homozygosity test of neutrality. Genetics. V. 88: P. 405-417.
  26. Welsh J., McClelland M. (1990) Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Research. V. 18 (22): P. 7213-7219
  27. Wright S. (1943) Isolation by distance. Genetics. Vol. 28: P. 114-138.
  28. Wright S. (1951) The genetical structure of populations. Ann. Eugenics. 1951. N 15. Р. 323-354.
  29. Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. (1994) Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) - anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics. V. 20 (2): P. 176-181.
  30. Yeh F. C.; Yang R., Boyle T. J. et al. (2000) POPGENE 32, Microsoft Window-based Freeware for Population Genetic Analysis, Version 1.32; Molecular Biology and Biotechnology Centre, Univ. of Alberta: Edmonton, Canada. http://www.ualberta.ca/~fyeh/popgene_download.html.

Statistics

Views

Abstract - 544

PDF (Russian) - 231

Cited-By


Article Metrics

Metrics Loading ...

PlumX

Dimensions


Copyright (c) 2015 Snegin E.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies