Hospital-acquired pneumonia in adults: the structure of pathogens and new features of etiological diagnosis


Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription or Fee Access

Abstract

Hospital-acquired pneumonia (HAP) is one of the most common infections associated with medical care. Due to the high prevalence of polyresistant, extreme resistant and panresistant bacteria, the choice of empirical antimicrobial therapy for HAP is a significant problem. The article highlights the etiological structure of HAP in adults, presents the main trends of antibiotic resistance among nosocomial pathogens in the Russian Federation, discusses modern methods of HAP etiological diagnosis, including promising areas based on nucleic acid amplification methods.

Full Text

Restricted Access

About the authors

Yu. A Yanovich

Peoples' Friendship University

Svetlana A. Rachina

Smolensk State Medical University

Email: svetlana.ratchma@antibiotic.ru
MD, Associate Professor, Department of Clinical Pharmacology

M. V Sukhorukova

Smolensk State Medical University

Yu. A Savochkina

Center for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks

M. V Vatsik

V.V. Vinogradov City Clinical Hospital

A. A Petrov

V.V. Vinogradov City Clinical Hospital

References

  1. Нозокомиальная пневмония у взрослых. Российские национальные рекомендации. Под ред. Б.Р. Гельфанда, отв. ред. Д.Н. Проценко, Б.З. Белоцерковский. 2-е изд., перераб. и доп. М., 2016. 176 с
  2. Kollef M., Hamilton С., Ernst F Economic impact of ventilator-associated pneumonia in large matched cohort. Infect Control Hosp Epidemiol. 2012;3:250-56. doi: 10.1086/664049
  3. Melsen W.G., Rovers M.M., Koeman M., et al. Estimating the attributable mortality of ventilator-associated pneumonia from randomized prevention studies. Critical Care Med. 2011;39(12):2736 42. doi: 10.1097/CCM.0b013e3182281f33
  4. Brito V, Niederman M.S. Healthcare-associated pneumonia is a heterogeneous disease, and all patients do not need the same broad-spectrum antibiotic therapy as complex nosocomial pneumonia. Curr Opin Inf Dis. 2009;22(3):316 25. doi: 10.1097/QC0.0b013e328329fa4e
  5. Torres A., Niederman M.S., Chastre J. International ERS/ESICM/ESCMID/ALAT guidelines for the management of hospital-acquired pneumonia and ventilator-associated pneumonia. Eur Respir J. 2017;50(3); pii:1700582. doi: 10.1183/13993003.00582-2017
  6. Рачина С.А., Сухорукова М.В., Петров А.А. и др. Особенности этиологии и микробиологическая диагностика при нозокомиальной пневмонии у взрослых. Практическая пульмонология 2017;4:45-51
  7. Barbier F, Andremont A., Wolff M., et al. Hospital-acquired pneumonia and ventilator-associated pneumonia: recent advances in epidemiology and management.. Curr Opin Pulm. Med 2013;19:216-28. Doi: 10.1097/ MCP0b013e32835f27be.
  8. Kalil A.C., Metersky M.L., Klompas M., et al. Management of Adults With Hospital-acquired and Ventilator-associated Pneumonia: 2016 Clinical Practice Guidelines by the Infectious Diseases Society of America and the American Thoracic Society. Clin Inf Dis. 2016;3(5):61-111.
  9. Petrov A., Quintana W., Mosquera P., et al. Etiology of nosocomial pneumonia in multidisciplinary hospital. Eur Respir J. 2018;52:PA1963. doi: 10.1183/13993003.congress-2018.PA1963.
  10. Яковлев С.В., Суворова М.П., Белобородов В.Б. и др. Распространенность и клиническое значение нозокомиальных инфекций в лечебных учреждениях России: исследование ЭРГИНИ. Антибиотики и химиотерапия 2016;61(5-6):32-42.
  11. Диагностика и лечение микозов в отделениях реанимации и интенсивной тера-пии. Pоссийские рекомендации. Отв. ред. Н.Н. Климко. 2-е изд., перераб. и доп. М., 2015. 96 с.
  12. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеено-ва Е.Ю. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФ0Н-2013-2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2017;19(1):49-56.
  13. Assimakopoulos S.F., Karamouzos V., Lefkaditi A., et al. Triple combination therapy with high-dose ampicillin/sulbactam, high-dose tigecycline and colistin in the treatment of ventilator-associated pneumonia caused by pan-drug resistant Acinetobacter baumannii: a case series study. Infez Med. 2019;27(1):11-6.
  14. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеено-ва Е.Ю. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцен трового эпидемиологического исследования МАРАФ0Н-2013-2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):42-8.
  15. Skleenova E., Sukhorukova M., Timokhova A., et al. Sharp increase in carbapenem-non-susceptibility and carbapenemase production rates in nosocomial Gram-negative bacteria in Russia over the last decade. Proceedings of 53rd Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC), 2012, Denver, CO, USA.
  16. Мартинович А.А. Динамика антибиотикорези-стентности и эпидемиология инфекций, вызванных Acinetobacter spp., в России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2010;12:96-105.
  17. Суворова М.П., Яковлев С.В., Басин Е.Е. и др. Современные рекомендации по антибактериальной терапии нозокомиальной пневмонии в ОРИТ на основании многоцентрового мониторинга возбудителей и резистентности в лечебно-профилактических учреждениях России. Фарматека. 2015;14(307):46-50.
  18. Эйдельштейн М.В., Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН 2013-2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):37-41.
  19. Романов А.В., Дехнич А.В., Сухорукова М.В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФ0Н-2013-2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):57-62.
  20. Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011-2012 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиоте-рапия.2014;16:280-86.
  21. Pastuovic T., Peric M., Bosnjak Z., et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in North-east Croatia. Acta Med Acad. 2015;44:10-7.
  22. Garcia L.S., Isenberg H.D. Clinical microbiology procedures handbook. 3rd ed. 3 Vol. set. Washington, DC: ASM Press; 2010.
  23. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Клинические рекомендации. Версия 2018-03. [Determination of the sensitivity of microorganisms to antimicrobial agents. Clinical guidelines. Version 2018-03. (In Russ.)]. URL: http://www.antibiotic. ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2018.pdf.
  24. Романов А.В., Дехнич А.В. Типирование MRSA: какие методы являются оптимальными для решения различных задач? Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2011;13:168-76. [Romanov A.V., Dekhnich A.V. Typing MRSA: which methods are optimal for solving various problems? Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2011;13:168-76.
  25. Dunne W.M. Jr, Jaillard M., Rochas O., et al. Microbial genomics and antimicrobial susceptibility testing. Exp RevMol Diagn. 2017;17(3):257-69.
  26. Ellington M.J., Ekelund O., Aarestrup F.M., et al. The role of whole genome sequencing in antimicrobial susceptibility testing of bacteria: report from the EUCAST Subcommittee. Clin Microbiol Infect. 2017;23(1):2-22. Doi:10.1016/j. cmi.2016.11.012
  27. Traczewski M.M., Carretto E., Moore N.M.; eCarba-RStudy Team. Multicenter Evaluation of the Xpert Carba-R Assay for Detection of Carbapenemase Genes in Gram-Negative Isolates. J Clin Microbiol. 2018;56(8):e00272-18.
  28. Kim S.Y., Park J.S., Hong Y.J., et al. Microarray-Based Nucleic Acid Assay and MALDI-TOF MS Analysis for the Detection of Gram-Negative Bacteria in Direct Blood Cultures. Am J. Clin Pathol. 2019;151(2):143-53.
  29. Pardo J., Klinker K.P., Borgert S.J., et al. Clinical and Economic impact of Antimicrobial Stewardship interventions With the FilmArray® Blood Culture Identification Panel. Diagn Microbiol Infect Dis. 2016;84(2):159-64. Doi 10.1016/j. diagmicrobio.2015.10.023.
  30. Schulte B., Eickmeyer H., Heininger A., et al. Detection of pneumonia associated pathogens using a prototype multiplexed pneumonia test in hospitalized patients with severe pneumonia. PLOS One. 2014;9(11):e11056. Doi: https://doi. org/10.1371/journal.pone.0110566.
  31. Papan C., Meyer-Buehn M., Laniado G., et al. Assessment of the multiplex PCR-based assay Unyvero pneumonia application for detection of bacterial pathogens and antibiotic resistance genes in children and neonates. Infection. 2018;46(2):189-96. doi: 10.1007/s15010-017-1088-y.
  32. Савочкина Ю.А.,Александрова И.А.,Ершова О.Н. и др. Использование молекулярно-генетических методов в этиологической диагностике бактериальных менингитов у нейрохирургических больных. XVII Международный конгресс по антимикробной терапии 20-22 мая 2015, Москва.
  33. Wong Y-P, Othman S., Lau Y.-L., et al. Loopmediated isothermal amplification (LAMP): a versatile technique for detection of microorganisms. J. Appl Microbiol. 2018;124(3):626- 43. doi: 10.1111/jam.13647.
  34. Barreda-Garcia S., Miranda-Castro R., de-Los-Santos-Alvarez N., et al. Helicase-dependent isothermal amplification: a novel tool in the development of molecular-based analytical systems for rapid pathogen detection. An Bioanal Chem. 2018;410:679-93. Doi: http://dx.doi. org/10.1007/s00216-017-0620-3
  35. Li J., Macdonald J., van Stetten F. Review: a comprehensive summary of a decade development of the recombinase polymerase amplification. Analyst. 2019;144:31-67.
  36. Mayboroda O., Katakis I., O’Sullivan C.K. Multiplexed isothermal nucleic acid amplification. Anal Biochem. 2018;545:20-30. Doi: https://doi. org/10.1016/j.ab.2018.01.005.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies