Том 23, № 1 (2025)
- Год: 2025
- Выпуск опубликован: 19.04.2025
- Статей: 8
- URL: https://journals.eco-vector.com/ecolgenet/issue/view/9820
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen.231
Генетические основы эволюции экосистем
Анализ роли Н+-АТФазы тонопласта в обеспечении роста растяжением клеток колеоптилей проростков риса, различающихся скоростью роста в условиях нормоксии и затопления
Аннотация
Актуальность. Одна из стратегий адаптации к затоплению у растительных организмов заключается в усилении роста с целью избежать повреждающего воздействия недостатка кислорода. К модельным объектам для изучения данного типа роста относят колеоптили проростков риса, обладающего способностью к прорастанию под водой. Длина колеоптилей служит маркером жизнеспособности при гипоксии.
Цель — сравнительный анализ роста колеоптилей и участия субъединиц B и E вакуолярной Н+-АТФазы в его реализации у двух сортов риса отечественной селекции, различающихся по исходной скорости удлинения (быстро растущий Кубань 3 и медленно растущий Аметист).
Материалы и методы. Исследование проведено на этилированных проростках колеоптилей риса двух сортов отечественной селекции Кубань 3 и Аметист. Детекцию субъединиц B и E V-АТФазы в составе общей микросомальной фракции реализовывали с использованием иммуно-блотт-анализа. Интенсивность транскрипции генов, кодирующих субъединицы B и E V-АТФазы, определяли методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией.
Результаты. Динамика роста в условиях аэрации более соответствовала изменениям субъединиц, происходящих на протеомном уровне, тогда как динамика роста при затоплении имела большее сходство с изменением транскрипции генов, кодирующих эти субъединицы. Сортовые различия были выявлены только при сравнении интенсивности транскрипции, что в конечном итоге не сказывалось на динамике роста колеоптилей.
Выводы. Показано участие субъединиц B и E V-АТФазы в обеспечении вакуолизации в процессе роста растяжением колеоптилей риса при различном содержании кислорода.
5-17
Влияние арбускулярной микоризы на экспрессию генов SWEET транспортеров у Medicago lupulina вусловиях высокого уровня доступного фосфора
Аннотация
Актуальность. Согласно современным представлениям, семейство SWEET может оказаться единственным семейством растительных транспортеров сахаров, включающим гены, специфически экспрессируемые при образовании и развитии симбиоза растений с грибами арбускулярной микоризы. Данные о ключевых генетических маркерах развития эффективного симбиоза, арбускулярной микоризы, могут послужить активному развитию биологического земледелия в различных условиях доступности фосфора в почве.
Цель — оценить влияние арбускулярной микоризы на экспрессию генов семейства SWEET у M. lupulina L. в ключевые фазы развития растения-хозяина (фазы розетки, начала стеблевания, стеблевания, начала бокового ветвления, бокового ветвления и цветения).
Материалы и методы. Исследование выполнено с использованием высокоэффективной растительно-микробной системы «Medicago lupulina + Rhizophagus irregularis», выращенной в условиях высокого содержания доступного фосфора в субстрате.
Результаты. При высоком содержании фосфора в субстрате впервые показано, что гены MlSWEET1b и MlSWEET3с в листьях люцерны характеризовались специфической экспрессией при микоризации.
Выводы. MlSWEET1b и MlSWEET3с и их ортологи могут рассматриваться в качестве генов-маркеров развития эффективного симбиоза, как инструмент биотехнологии для повышения продуктивности сельского хозяйства при применении биостимуляторов на основе грибов арбускулярной микоризы.
19-32
Экологическая генетика жуков рода Adalia: динамика перестройки популяции A. bipunctata Архангельска в условиях глобального потепления
Аннотация
Изучена динамика состава популяции Adalia bipunctata L. в Архангельске на протяжении 21 года. Доля черных особей снизилась почти в 2 раза; среднегодовая температура в то же время возросла с 1,92° до 2,95°. Сопоставление состава популяции со средней годовой температурой показало, что доля черных особей отрицательно коррелирует со среднегодовой температурой. Наблюдаемое изменение состава популяции является, вероятно, эффектом глобального потепления.
33-38
Методология экологической генетики
Скорострельная протеомика в изучении адаптивных реакций растений на стресс
Аннотация
В связи со стремительным изменением климата засуха, экстремально высокие температуры и засоление почв стали заметными экологическими стрессорами, которые на данный момент встречаются в большинстве наземных экосистем. В связи с исключительным влиянием этих факторов на сельское хозяйство, биохимия и молекулярная биология стрессовых реакций растений последние несколько десятилетий остается в центре исследовательского интереса во всем мире. Так, протеомика «снизу-вверх» стала универсальным инструментом исследования растений в целом и биологии клеточного стресса в частности. Растения считаются сложным объектом для исследования: их клетки богаты полисахаридами, полифенолами и труднорастворимыми в воде белками, поэтому их протеом обычно анализируют с помощью электрофоретических методов. Однако последние достижения в области методов пробоподготовки (в первую очередь, солюбилизации и переваривания белков) позволили создать «безгелевые» методы для образцов растительного происхождения. Внедрение высокопроизводительной нанопоточной обратно-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии, соединенной с масс-спектрометрией с ионизацией электрораспылением (nanoRP-HPLC-ESI-MS), обеспечило доступ к массивам данных с высокой скоростью идентификации белков. Кроме того, высокая воспроизводимость высокоэффективной жидкостной хроматографии позволяет проводить высокочувствительное и точное количественное определение. Поэтому в последнее десятилетие дробовая протеомика стала методом выбора при изучении адаптивных стрессовых реакций протеома растений. В данном обзоре рассматриваются стратегии шотган-протеомики «снизу-вверх» в биологии растений и обсуждается ее применение для изучения стрессовых реакций растений. В статье также обсуждаются основные этапы анализа протеома растений, возникающие проблемы и перспективы.
39-63
Использование генетического картирования локусов количественных признаков (QTL) для изучения взаимодействия гороха посевного (Pisum sativum L.) с ризосферными микроорганизмами
Аннотация
Обзор посвящен применению анализа локусов количественных признаков (QTL) для изучения взаимодействий гороха посевного (Pisum sativum L.) — одной из важнейших зернобобовых культур — с почвенными микроорганизмами. Горох, как и другие бобовые растения, образует симбиозы с клубеньковыми бактериями и грибами арбускулярной микоризы. Формирование симбиозов приводит к улучшению азотного и фосфорного питания растений, в результате чего повышается устойчивость растений к абиотическим и биотическим стрессовым факторам, в частности, к воздействию фитопатогенов. Основная задача QTL-анализа состоит в идентификации участков генома, аллельное состояние которых влияет на проявление количественных признаков, в том числе таких как эффективность фиксации азота и устойчивость к патогенам. Выявленные QTL и создаваемые на их основе молекулярные маркеры могут быть использованы при селекции новых сортов гороха с улучшенными агрономическими характеристиками, например устойчивостью к изменяющимся условиям окружающей среды и высокой эффективностью симбиотических систем. В данной статье рассматриваются исторические этапы развития QTL-анализа, основные принципы картирования QTL и современные подходы. Отмечена необходимость комплексного подхода к анализу признаков эффективности симбиоза и устойчивости, обсуждается использование интегральных фенотипических оценок для работы с подобными признаками.
65-79
Редактирование генома гороха посевного (Pisum sativum L.) с использованием технологии CRISPR/Cas9: обзор
Аннотация
Обзорная статья описывает достижения в области геномного редактирования гороха посевного (Pisum sativum L.) при помощи технологии CRISPR/Cas9. Несмотря на более чем десятилетнее использование CRISPR/Cas9 в биотехнологии растений, первый успех в редактировании генома гороха был достигнут только в 2023 г.: ученым удалось получить мутации в модельном гене PsPDS, нарушение работы которого приводит к альбинизму растений. К настоящему моменту при помощи CRISPR/Cas9 удалось внести мутации в ген PsLOX2, кодирующий липоксигеназу, в результате чего в семенах снизилась концентрация летучих соединений, придающих им непривлекательный запах, и в ген PsBAS1, что привело к блокированию синтеза сапонинов в семенах гороха и, как следствие, к улучшению их вкусовых качеств. Авторы данных исследований подчеркивают необходимость дальнейшей оптимизации существующих протоколов трансформации для повышения их эффективности и решения проблемы низкой регенерационной способности гороха. В обзоре также кратко описана история открытия метода CRISPR-Cas9 и его становления как одного из ведущих инструментов геномного редактирования. Кроме того, рассмотрены модификации метода CRISPR/Cas9, повышающие точность вносимых изменений, и потенциал их применения к редактированию генома гороха. Ключевым моментом статьи является представление перспективы использования CRISPR/Cas9 в качестве инструмента для управления специфичностью и эффективностью симбиоза гороха с клубеньковыми бактериями, что может способствовать созданию устойчивых и продуктивных агроэкосистем.
81-98
Проблемы генетического образования
Роль генетической коллекции дрозофилы в формировании направлений исследований и в образовательном процессе на кафедре генетики и биотехнологии Санкт-Петербургского государственного университета
Аннотация
Генетический анализ как основополагающий метод генетики возможен при обязательном выполнении условия — наличие наследственно различающихся вариантов одних и тех же признаков. Успешность проведения анализа зависит от широты разнообразия наследственных форм, имеющихся у исследователя. В этой связи создание и поддержание генетических коллекций представляет собой первый этап осуществления генетического анализа. В настоящее время генетические коллекции, в том числе дрозофилы, не потеряли своей первостепенной значимости даже несмотря на очевидное превосходство молекулярных методов в генетике и смещение исследований на уровень признаков, характеризующих особенности отдельных молекул. Во многом именно коллекционный материал служит отправной точкой в становлении новых направлений исследований в современной генетике. Кроме того, нельзя не отметить, что задача образовательного процесса в университете — это формирование у учащегося способности к анализу, критическому оцениванию результатов эксперимента, понимание студентом логики постановки эксперимента. В этой связи использование генетических коллекций — неотъемлемая часть образовательного процесса, позволяющая стимулировать развитие требуемых качеств.
99-106
История и персоналии, рецензии, информация
Рецензия на сборник тезисов Четвертой Международной конференции «Генетически модифицированные организмы: история, достижения, социальные и экологические риски», Санкт-Петербург, 21–23 октября 2024 г.
Аннотация
Сборник тезисов Четвертой Международной конференции «Генетически модифицированные организмы: история, достижения, социальные и экологические риски» содержит 38 тезисов, охватывающих широкую область исследований генетически модифицированных организмов. В настоящее время генетически модифицированные организмы, их создание и изучение является неотъемлемой частью многих исследований, а также частью современного сельского хозяйства. Результаты, представленные в сборнике, относятся к различным областям исследований и выполнены на широком спектре организмов (растениях, животных, грибах и водорослях).
107-109




